RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 USP17L23D6RBM5 183 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 ATP5LO75964 103 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 PRSS1P07477 247 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 ST20Q9HBF5 79 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 DDTP30046 118 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01545Q5VT33 79 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 SCXQ7RTU7 201 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 A0A096LNJ9 63 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 H7C423 109 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 UBE2L6O14933 153 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 MYCBP2O75592 4640 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 VCYO14598 125 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 KIR2DL4Q99706 377 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 PRO1933Q9H354 126 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 I3L3M4 83 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 GAS8-AS1O95177 125 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 SPATA45Q537H7 98 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00587B1AMM8 73 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-210ENST00000462125 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 FGF6P10767 208 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 TOMM6Q96B49 74 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 TSHBP01222 138 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 SLPIP03973 132 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZN92 141 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 hDV102S1A0JD36 115 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 H0Y8G0 127 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 IGLC3P0DOY3 106 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 CFAP161Q6P656 301 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 ERASQ7Z444 233 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 ATOH7Q8N100 152 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM141Q96I45 108 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 DPM2O94777 84 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 C15orf56Q8N910 161 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 TIMM17AQ99595 171 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 PANO1I0J062 215 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 NPSP0C0P6 89 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 PLNP26678 52 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 ODF1Q14990 250 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM101Q96IK0 257 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 IGKCP01834 107 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 FOXI1Q12951 378 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 C14orf144Q96I85 54 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 F8VRH5 84 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 M0R143 59 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 CCL25O15444 150 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 COX8AP10176 69 aa8.42□□□□□ -1.06
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