RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448333.1

KCTD3-202, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene KCTD3, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3-202ENST00000448333 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.07□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.07□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 Q6ZRU5 148 aa6.07□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.07□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.06□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 A0A1B0GXF2 115 aa6.06□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 APOMO95445 188 aa6.06□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 ORMDL3Q8N138 153 aa6.06□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 PRELID3AQ96N28 172 aa6.06□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.06□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.06□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.05□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.05□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 PPBPP02775 128 aa6.05□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 SPAG11BQ08648 103 aa6.05□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 A0A0J9YXV3 536 aa6.04□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 IFITM10A6NMD0 228 aa6.04□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 MT-ND4LP03901 98 aa6.04□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 PTTG1IPP53801 180 aa6.04□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.04□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.04□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.04□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.03□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 C2orf48Q96LS8 159 aa6.03□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.03□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.03□□□□□ -1.44
KCTD3-202ENST00000448333 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.02□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 A0A1W2PNN7 141 aa6.02□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 FAM104AQ969W3 186 aa6.02□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.01□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.01□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 NDUFA1O15239 70 aa6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 MT1HL1P0DM35 61 aa6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 C4orf48Q5BLP8 95 aa6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 TEX43Q6ZNM6 134 aa6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 Q6ZRP5 223 aa6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 TMEM141Q96I45 108 aa6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 GAGE2EQ4V326 116 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 C10orf25Q5T742 122 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 Q6ZN92 141 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 Q8N8P6 123 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 IMMP2LQ96T52 175 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.99□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 PRSS47A8MTI9 375 aa5.98□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 MT-ND6P03923 174 aa5.98□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.98□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 CLLU1Q5K131 121 aa5.98□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.98□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.98□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 VCX2Q9H322 139 aa5.98□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 A0A087WZ39 114 aa5.97□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 F8WDY8 70 aa5.97□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 RNF151Q2KHN1 245 aa5.97□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.97□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 REG3GQ6UW15 175 aa5.97□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.97□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.97□□□□□ -1.45
KCTD3-202ENST00000448333 FAM168BA1KXE4 195 aa5.96□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 UBE2D1P51668 147 aa5.96□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 C1orf137Q5JT78 98 aa5.96□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 C2orf82Q6UX34 121 aa5.96□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 LINC01600Q96MT4 127 aa5.96□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.96□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.95□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 TMEM218A2RU14 115 aa5.95□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 PRSS2P07478 247 aa5.95□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 ADCYAP1P18509 176 aa5.95□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 KIAA0087Q14695 138 aa5.95□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 ODF1Q14990 250 aa5.95□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.95□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 S100PP25815 95 aa5.94□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.94□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 UQCC3Q6UW78 93 aa5.94□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 AMELXQ99217 191 aa5.94□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.94□□□□□ -1.46
KCTD3-202ENST00000448333 IGIPA6NJ69 53 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.2 ms