RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.62□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.62□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.62□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 IGIPA6NJ69 53 aa7.61□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 MALP21145 153 aa7.61□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.61□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.61□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 COMMD7Q86VX2 200 aa7.61□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 STPG4Q8N801 248 aa7.61□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 C2orf48Q96LS8 159 aa7.61□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.6□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 OXTP01178 125 aa7.6□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.6□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.6□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.6□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 AMELXQ99217 191 aa7.6□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 IFITM10A6NMD0 228 aa7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 J3QL48 77 aa7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 K7EMI3 77 aa7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 APOMO95445 188 aa7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 UBE2D1P51668 147 aa7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 PTTG1IPP53801 180 aa7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 KIAA0087Q14695 138 aa7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM141Q96I45 108 aa7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.59□□□□□ -1.19
RPSAP46-201ENST00000428316 A0A087WZ39 114 aa7.58□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 SPAG11BQ08648 103 aa7.58□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 RNF151Q2KHN1 245 aa7.58□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.58□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 C10orf25Q5T742 122 aa7.58□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 A0A0J9YXV3 536 aa7.57□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.57□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 A0A1W2PNN7 141 aa7.57□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 LINC01546A6NGU7 62 aa7.57□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 NPSP0C0P6 89 aa7.57□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.57□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.57□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.57□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.57□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 F8WDY8 70 aa7.56□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 GAGE2BQ13066 116 aa7.56□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.56□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.56□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.56□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.55□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 MT1HL1P0DM35 61 aa7.55□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 C7orf33Q8WU49 177 aa7.55□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 TOMM6Q96B49 74 aa7.55□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 VCX2Q9H322 139 aa7.55□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.54□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.54□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.54□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.53□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.53□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 S100PP25815 95 aa7.53□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 RHEBQ15382 184 aa7.53□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 Q6ZRP5 223 aa7.53□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 TIMM17AQ99595 171 aa7.53□□□□□ -1.2
RPSAP46-201ENST00000428316 NDUFA1O15239 70 aa7.52□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 COX19Q49B96 90 aa7.52□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 C2orf82Q6UX34 121 aa7.52□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.52□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 TNXBP22105 4242 aa7.51□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 G0S2P27469 103 aa7.51□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 Q6ZN92 141 aa7.51□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 ERASQ7Z444 233 aa7.51□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.51□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.5□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.5□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.5□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM168BA1KXE4 195 aa7.49□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 MT-ND6P03923 174 aa7.49□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.49□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 A0A096LNJ9 63 aa7.48□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.48□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 HERVK_113P63121 156 aa7.48□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.48□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.48□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 YPEL4Q96NS1 127 aa7.48□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 APOC3P02656 99 aa7.47□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 SEC11AP67812 179 aa7.47□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.47□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 Q8IZM0 81 aa7.47□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 LINC01600Q96MT4 127 aa7.47□□□□□ -1.21
RPSAP46-201ENST00000428316 CST9LQ9H4G1 147 aa7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms