RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381565.2

APOBEC3F-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3F, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 CHTF8P0CG12 524 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 RAB5AP20339 215 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 S100PP25815 95 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 IFITM10A6NMD0 228 aa7.34□□□□□ -1.23
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APOBEC3F-202ENST00000381565 APOC3P02656 99 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 COX6A2Q02221 97 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 C5orf38Q86SI9 138 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.33□□□□□ -1.24
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APOBEC3F-202ENST00000381565 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM141Q96I45 108 aa7.33□□□□□ -1.24
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APOBEC3F-202ENST00000381565 A0A096LNI7 61 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGIPA6NJ69 53 aa7.32□□□□□ -1.24
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APOBEC3F-202ENST00000381565 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 UBE2D1P51668 147 aa7.31□□□□□ -1.24
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APOBEC3F-202ENST00000381565 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.29□□□□□ -1.24
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APOBEC3F-202ENST00000381565 C2orf48Q96LS8 159 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 A0A087WZ39 114 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 APOMO95445 188 aa7.28□□□□□ -1.24
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APOBEC3F-202ENST00000381565 NDUFA5Q16718 116 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3F-202ENST00000381565 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.28□□□□□ -1.24
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APOBEC3F-202ENST00000381565 MAJINQ3KP22 176 aa7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 Q6ZN92 141 aa7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.27□□□□□ -1.25
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APOBEC3F-202ENST00000381565 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 C10orf25Q5T742 122 aa7.26□□□□□ -1.25
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APOBEC3F-202ENST00000381565 VCX2Q9H322 139 aa7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.25□□□□□ -1.25
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APOBEC3F-202ENST00000381565 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.25□□□□□ -1.25
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APOBEC3F-202ENST00000381565 G0S2P27469 103 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 RNF151Q2KHN1 245 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 FA2HQ7L5A8 372 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.24□□□□□ -1.25
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