RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV1-69P01742 117 aa7.79□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.79□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.79□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.79□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.79□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.79□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q9UF83 564 aa7.79□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A087WYN8 130 aa7.79□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.79□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZANQ9Y493 2812 aa7.78□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITPR1Q14643 2758 aa7.78□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.78□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.78□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 POLQO75417 2590 aa7.78□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRB1P04280 392 aa7.78□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.78□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.78□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.78□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.77□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLPIP03973 132 aa7.76□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00315P59091 139 aa7.75□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 ESRGQ1W209 222 aa7.75□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.75□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A087WW49 117 aa7.75□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.75□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD28P10747 220 aa7.75□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.75□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 FLNCQ14315 2725 aa7.75□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 MIFP14174 115 aa7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 HTN1P15515 57 aa7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 LMO4P61968 165 aa7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 C19orf84I3L1E1 186 aa7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.74□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRM2P04554 102 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 LECT2O14960 151 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSPHP1O15172 72 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFC1O43677 76 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.73□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 A8MU10 97 aa7.72□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 H3BUX3 64 aa7.72□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q9H8V8 135 aa7.72□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 APOC4P55056 127 aa7.72□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.72□□□□□ -1.17
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBL5Q9BZL1 73 aa7.71□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZTI0 123 aa7.7□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.7□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.69□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.69□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFA1O15239 70 aa7.69□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.69□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.68□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 HAMPP81172 84 aa7.68□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM104AQ969W3 186 aa7.68□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 PROK1P58294 105 aa7.68□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.67□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFA4O00483 81 aa7.67□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRPP02741 224 aa7.67□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.67□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.67□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.67□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.67□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.66□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.66□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.66□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.66□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.66□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 BCE1O60756 84 aa7.66□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZRP5 223 aa7.66□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.66□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.65□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.65□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.65□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N3U1 123 aa7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 197.8 ms