RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 Q5XG85 94 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 C22orf24Q9Y442 160 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF415Q09FC8 603 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 BRK1Q8WUW1 75 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 NBL1P41271 181 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 PSMB8P28062 276 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 POLQO75417 2590 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 ACACBO00763 2458 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 J3QLI3 93 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 UBL5Q9BZL1 73 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 JMJD1CQ15652 2540 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 UPK3BQ9BT76 320 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 MRAPQ8TCY5 172 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 VPS13CQ709C8 3753 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 K7ENP7 123 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 PRORYQ9H606 182 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 CUBNO60494 3623 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 ZFHX3Q15911 3703 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 H0YGX0 51 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 XCL1P47992 114 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 XCL2Q9UBD3 114 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 NDUFC2O95298 119 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 K7EQG2 157 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 COX7B2Q8TF08 81 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 FLNCQ14315 2725 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 ITPR1Q14643 2758 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 CCL18P55774 89 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV2D-28P01615 120 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 PF4P02776 101 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 UCNP55089 124 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 PRO0628Q9UI54 55 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 DEFB136Q30KP8 78 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 RMI2Q96E14 147 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-201ENST00000283228 SCXQ7RTU7 201 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 Q6ZTI0 123 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 Q96MF0 132 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 F8WEM9 126 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 CCKP06307 115 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 LMO4P61968 165 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 K7EMT4 169 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM86BQ8N661 226 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 LRRK2Q5S007 2527 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1W2PPR1 153 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 H3BUA1 57 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 KLK9Q2XQG4 91 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 SLURP1P55000 103 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 INSP01308 110 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRR-201ENST00000283228 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV4-59P01825 116 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 C19orf84I3L1E1 186 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 K7EQD1 137 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 ZANQ9Y493 2812 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 A6NDX4 124 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-201ENST00000283228 DAD1P61803 113 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms