RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 A0A096LNI7 61 aa11.72□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 EML5Q05BV3 1969 aa11.72□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 WNK1Q9H4A3 2382 aa11.72□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa11.71□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 FSTL3O95633 263 aa11.71□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 C14orf177Q52M58 125 aa11.71□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 Q8IZM0 81 aa11.71□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 NUP210LQ5VU65 1888 aa11.7□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 PRR14LQ5THK1 2151 aa11.7□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 LINC00208Q96KT6 92 aa11.7□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 AMELXQ99217 191 aa11.7□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.69□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.69□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.69□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 MUC7Q8TAX7 377 aa11.69□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.68□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.67□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 Q8N6K4 173 aa11.67□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 LMO4P61968 165 aa11.67□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.67□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 IGKV2D-28P01615 120 aa11.67□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 COX6A2Q02221 97 aa11.67□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZVQ6 151 aa11.67□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.66□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 INAFM1C9JVW0 142 aa11.66□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.66□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 LINC01546A6NGU7 62 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-201ENST00000256413 SYCNQ0VAF6 134 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 PRM2P04554 102 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 AGRNO00468 2067 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 BCE1O60756 84 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 CXCL6P80162 114 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 A0A087WZ39 114 aa11.59□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.59□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 LY6G6DO95868 133 aa11.58□□□□□ -0.55
CTIF-201ENST00000256413 LINC00575Q6W349 94 aa11.58□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.58□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 C1orf137Q5JT78 98 aa11.57□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.57□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.56□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 LIMD2Q9BT23 127 aa11.56□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 IGHV4-31P0DP07 118 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 SORL1Q92673 2214 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-201ENST00000256413 hDV103S1A0JD37 113 aa11.52□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 TECTAO75443 2155 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 H0Y9P7 68 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 LELP1Q5T871 98 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 Q6YL49 198 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 C7orf33Q8WU49 177 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 IGLV1-40P01703 118 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 Q8NA96 180 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 Q8N2B8 174 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 PRO3102Q9H379 93 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 PCOTHQ58A44 107 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 C10orf25Q5T742 122 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 ATRXP46100 2492 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 FSHBP01225 129 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 LY6G6CO95867 125 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 HCG22E2RYF7 251 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-201ENST00000256413 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.46□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.46□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 SPG11Q96JI7 2443 aa11.44□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 FHL3Q13643 280 aa11.44□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 FHL2Q14192 279 aa11.44□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 EDN2P20800 178 aa11.44□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.44□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZSN1 163 aa11.43□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 SMIM29Q86T20 159 aa11.43□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 A8MTW9 85 aa11.42□□□□□ -0.58
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