RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636154.2

RAB34-223, Transcript of RAB34, member RAS oncogene family, human

TSL 2 BASIC

Gene RAB34, Length 730 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB34-223	ENST00000636154	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154		Q5VSD8	79 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	hDV102S1	A0JD36	115 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154		D6R8Y8	96 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	ORMDL3	Q8N138	153 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	TNFRSF6B	O95407	300 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	LINC01620	Q4KN68	170 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	CCL25	O15444	150 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	HAMP	P81172	84 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	IMMP2L	Q96T52	175 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB34-223	ENST00000636154	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	IFITM2	Q01629	132 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	SS18	Q15532	418 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	TMEM218	A2RU14	115 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	SCX	Q7RTU7	201 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	NPY	P01303	97 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	XCL1	P47992	114 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	FOXI1	Q12951	378 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	C15orf56	Q8N910	161 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	PRELID3A	Q96N28	172 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	SEC11C	Q9BY50	192 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	RAB5A	P20339	215 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	ADCYAP1	P18509	176 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RAB34-223	ENST00000636154	PRSS47	A8MTI9	375 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	COMMD7	Q86VX2	200 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154		K7EMI3	77 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	S100P	P25815	95 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154		Q6ZUT4	128 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	COX7A2L	O14548	114 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	SLPI	P03973	132 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	MAL	P21145	153 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	RHEB	Q15382	184 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154		Q8N8P6	123 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RAB34-223	ENST00000636154	APOM	O95445	188 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	G0S2	P27469	103 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	COX19	Q49B96	90 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	IFITM10	A6NMD0	228 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	NPS	P0C0P6	89 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	CARD19	Q96LW7	228 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	COX6A2	Q02221	97 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154		Q6ZN92	141 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	DPH3	Q96FX2	82 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	TMEM141	Q96I45	108 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	MYCBP2	O75592	4640 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	MT-ND6	P03923	174 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	SYCN	Q0VAF6	134 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RAB34-223	ENST00000636154	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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