RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610236.1

LINC00649-215, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00649, Length 196 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-215ENST00000610236 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.5□□□□□ -1.05
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LINC00649-215ENST00000610236 KIR2DL4Q99706 377 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-215ENST00000610236 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-215ENST00000610236 MYCBP2O75592 4640 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-215ENST00000610236 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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LINC00649-215ENST00000610236 HBBP68871 147 aa8.49□□□□□ -1.05
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LINC00649-215ENST00000610236 SLPIP03973 132 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00649-215ENST00000610236 CKS2P33552 79 aa8.48□□□□□ -1.05
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LINC00649-215ENST00000610236 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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LINC00649-215ENST00000610236 XCL1P47992 114 aa8.46□□□□□ -1.06
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LINC00649-215ENST00000610236 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.46□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 TMEM18Q96B42 140 aa8.46□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 PANO1I0J062 215 aa8.45□□□□□ -1.06
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LINC00649-215ENST00000610236 TNFRSF6BO95407 300 aa8.45□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 PPBPP02775 128 aa8.45□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
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LINC00649-215ENST00000610236 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.45□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.45□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 HERC1Q15751 4861 aa8.45□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.44□□□□□ -1.06
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LINC00649-215ENST00000610236 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.44□□□□□ -1.06
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LINC00649-215ENST00000610236 MT-ND4LP03901 98 aa8.43□□□□□ -1.06
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LINC00649-215ENST00000610236 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.42□□□□□ -1.06
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LINC00649-215ENST00000610236 A0A087WYN8 130 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 CHTF8P0CG12 524 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 Q6ZUT4 128 aa8.4□□□□□ -1.06
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LINC00649-215ENST00000610236 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00649-215ENST00000610236 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 COX7A2LO14548 114 aa8.39□□□□□ -1.07
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LINC00649-215ENST00000610236 PRELID3AQ96N28 172 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 PRSS47A8MTI9 375 aa8.38□□□□□ -1.07
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LINC00649-215ENST00000610236 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 UQCC3Q6UW78 93 aa8.38□□□□□ -1.07
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LINC00649-215ENST00000610236 SYCNQ0VAF6 134 aa8.37□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.37□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 APOMO95445 188 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 OXTP01178 125 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 MAJINQ3KP22 176 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 FAM104AQ969W3 186 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 IMMP2LQ96T52 175 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 A0A096LNI7 61 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 C5orf38Q86SI9 138 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 C7orf33Q8WU49 177 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 C2orf48Q96LS8 159 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 TMEM218A2RU14 115 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 IFITM2Q01629 132 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00649-215ENST00000610236 STPG4Q8N801 248 aa8.34□□□□□ -1.07
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