RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf77A4D0Y5 90 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXI1Q12951 378 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 TWIST1Q15672 202 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 OCC1Q8TAD7 63 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ISOC2Q96AB3 205 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 CNFNQ9BYD5 112 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS10P5Q9NQ39 176 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 BIN3Q9NQY0 253 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT10Q8NFP7 164 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT11Q96G61 164 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 MT-ND4LP03901 98 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF6P10767 208 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP10-8P60410 259 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R2P9O14990 202 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 NCR2O95944 276 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 APCSP02743 223 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SPINK6Q6UWN8 80 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ANAPC16Q96DE5 110 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM242Q9NWH2 141 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 H7C423 109 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00526Q96FQ7 95 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 K7EN84 100 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 XCL1P47992 114 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SCO1O75880 301 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 REG3GQ6UW15 175 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5A1Q8NGJ0 315 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SMCO4Q9NRQ5 59 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00474Q9P2X8 69 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM231DQ6ZW35 169 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 OSTCQ9NRP0 149 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SDHAF1A6NFY7 115 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CARD19Q96LW7 228 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL25O15444 150 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM231BA6NCW3 169 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZRP5 223 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PKIGQ9Y2B9 76 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CBLN2Q8IUK8 224 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 IMMP2LQ96T52 175 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 I3L3M4 83 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM15Q7Z3B0 74 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM101Q96IK0 257 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 BTF3L4Q96K17 158 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PMCHP20382 165 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-211ENST00000590874 GATCO43716 136 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GAS8-AS1O95177 125 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ESDP10768 282 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SYCNQ0VAF6 134 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 CT83Q5H943 113 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 V9GYV3 84 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TSHBP01222 138 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 S100PP25815 95 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PTTG1IPP53801 180 aa15.81■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SS18Q15532 418 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa15.79■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MRAP2Q96G30 205 aa15.79■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMPP49913 170 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE2BQ13066 116 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 YPEL4Q96NS1 127 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PNN7 141 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ST20Q9HBF5 79 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MWL6 223 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF664Q8N3J9 261 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 TSKUQ8WUA8 353 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 COLCA2A8K830 154 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP35Q8NFH5 326 aa15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 LPAP08519 4548 aa15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 NAT8BQ9UHF3 227 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MALP21145 153 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 COX7A2LO14548 114 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 APOMO95445 188 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMK2N2Q96S95 79 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB5AP20339 215 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
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