RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580357.1

IFT20-210, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 3

Gene IFT20, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-210	ENST00000580357	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-210	ENST00000580357	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-210	ENST00000580357	USP17L23	D6RBM5	183 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-210	ENST00000580357	RAB5A	P20339	215 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-210	ENST00000580357	KRTAP10-1	P60331	282 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-210	ENST00000580357	CFAP161	Q6P656	301 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-210	ENST00000580357	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	CCL25	O15444	150 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	NPY	P01303	97 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	RHEB	Q15382	184 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	COX19	Q49B96	90 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		10.75	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		10.75	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	SS18	Q15532	418 aa		10.75	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	NDUFA5	Q16718	116 aa		10.75	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357		K7EMI3	77 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	PRSS1	P07477	247 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	XG	P55808	180 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	SNAPIN	O95295	136 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	G0S2	P27469	103 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	SVBP	Q8N300	66 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357		Q8N8P6	123 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IFT20-210	ENST00000580357	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		10.7	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	APOC3	P02656	99 aa		10.7	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357		Q8N1X5	172 aa		10.7	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	hDV102S1	A0JD36	115 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	MT-ND6	P03923	174 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	XCL1	P47992	114 aa		10.68	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	FOXI1	Q12951	378 aa		10.68	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		10.68	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		10.68	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357		Q6ZSA8	131 aa		10.67	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		10.66	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	NPS	P0C0P6	89 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IFT20-210	ENST00000580357	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357		Q6ZUT4	128 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	C15orf56	Q8N910	161 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	LINC01549	A6NIU2	74 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	MAL	P21145	153 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	LINC01620	Q4KN68	170 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	EPM2A	B3EWF7	344 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	FAM229A	H3BQW9	127 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	COX7A2L	O14548	114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM141	Q96I45	108 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	APOM	O95445	188 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357		Q6ZN92	141 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	FAM104A	Q969W3	186 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	IFITM10	A6NMD0	228 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	SLPI	P03973	132 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	VCX2	Q9H322	139 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IFT20-210	ENST00000580357	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		10.58	□□□□□ -0.72
IFT20-210	ENST00000580357	LINC01546	A6NGU7	62 aa		10.58	□□□□□ -0.72
IFT20-210	ENST00000580357	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		10.58	□□□□□ -0.72
IFT20-210	ENST00000580357	HSPG2	P98160	4391 aa		10.58	□□□□□ -0.72

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