RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HIGD1CA8MV81 97 aa17.78■□□□□ 0.44
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP17.46■□□□□ 0.39
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMIM2Q9BVW6 85 aa17.44■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 D6R8Y8 96 aa17.43■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PEA15Q15121 130 aa17.43■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
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