RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566121.1

CMTM3-212, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-212ENST00000566121 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.62□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 V9GYV3 84 aa9.62□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 RIGQ13278 110 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 NUP35Q8NFH5 326 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1B0GW15 77 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 LINC00862A6NCI5 91 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 PPP1R2P9O14990 202 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 COX6A2Q02221 97 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 ISOC2Q96AB3 205 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM3-212ENST00000566121 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 TCAPO15273 167 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 GAS8-AS1O95177 125 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 CEBPGP53567 150 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 SS18Q15532 418 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 NRACQ8N912 160 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 DPH3Q96FX2 82 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.57□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 AMN1Q8IY45 258 aa9.57□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.57□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 C7orf33Q8WU49 177 aa9.57□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 C20orf78Q9BR46 151 aa9.57□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.57□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.56□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.56□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 CHTF8P0CG12 524 aa9.56□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.56□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 KIR2DL4Q99706 377 aa9.56□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 MT1HL1P0DM35 61 aa9.55□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 XCL1P47992 114 aa9.55□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.55□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 NAT8Q9UHE5 227 aa9.55□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 TMEM18Q96B42 140 aa9.54□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 PHOX2AO14813 284 aa9.53□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 PEA15Q15121 130 aa9.53□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.53□□□□□ -0.88
CMTM3-212ENST00000566121 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 FCER1GP30273 86 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 MAJINQ3KP22 176 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 C2orf48Q96LS8 159 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 C9JQL5 133 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 F8WDY8 70 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 PPBPP02775 128 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 S100A8P05109 93 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 SYCNQ0VAF6 134 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 STPG4Q8N801 248 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 CARD19Q96LW7 228 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 A0A096LNI7 61 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 COX7A2LO14548 114 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 RNF151Q2KHN1 245 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 F8W036 122 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 SMKR1H3BMG3 65 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 CAMPP49913 170 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 ADIRFQ15847 76 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1B0GXF2 115 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 CKS2P33552 79 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 LINC01600Q96MT4 127 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 APOMO95445 188 aa9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 PTTG1IPP53801 180 aa9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 HBBP68871 147 aa9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-212ENST00000566121 PRSS47A8MTI9 375 aa9.46□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 TNFRSF6BO95407 300 aa9.46□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 MALP21145 153 aa9.46□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.46□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 FAM104AQ969W3 186 aa9.46□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.46□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.45□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 Q6ZRP5 223 aa9.45□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.45□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 LRP2P98164 4655 aa9.44□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.43□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 IFITM2Q01629 132 aa9.43□□□□□ -0.9
CMTM3-212ENST00000566121 Q6ZUT4 128 aa9.43□□□□□ -0.9
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