RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565362.5

PDXDC1-211, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-211ENST00000565362 BORCS7Q96B45 105 aa6.75□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 MRAP2Q96G30 205 aa6.75□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM101Q96IK0 257 aa6.75□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.75□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.75□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.75□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 CCL25O15444 150 aa6.74□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 XCL1P47992 114 aa6.74□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 CEBPGP53567 150 aa6.74□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 MAJINQ3KP22 176 aa6.74□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 C7orf33Q8WU49 177 aa6.74□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 A0A096LNI7 61 aa6.73□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.73□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF727A8MUV8 499 aa6.73□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.73□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 AMN1Q8IY45 258 aa6.73□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.73□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 STPG4Q8N801 248 aa6.73□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 V9GYV3 84 aa6.73□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.72□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 VCYO14598 125 aa6.72□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 SS18Q15532 418 aa6.72□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 NUP35Q8NFH5 326 aa6.72□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.72□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.72□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PDXDC1-211ENST00000565362 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.71□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 PPP1R17O96001 155 aa6.71□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 RIGQ13278 110 aa6.71□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 NRACQ8N912 160 aa6.71□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 ISOC2Q96AB3 205 aa6.71□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.71□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 CARD19Q96LW7 228 aa6.71□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 SMKR1H3BMG3 65 aa6.7□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 SYCNQ0VAF6 134 aa6.7□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.7□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 LINC01600Q96MT4 127 aa6.7□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.7□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.69□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.69□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.69□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.69□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.68□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.68□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 LINC00862A6NCI5 91 aa6.68□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 PPP1R2P9O14990 202 aa6.68□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 FCER1GP30273 86 aa6.68□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 CAMPP49913 170 aa6.68□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.68□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 KIR2DL4Q99706 377 aa6.68□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.68□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.67□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 C9JQL5 133 aa6.67□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 COX7A2LO14548 114 aa6.67□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 PTTG1IPP53801 180 aa6.67□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.67□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 C20orf78Q9BR46 151 aa6.67□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.66□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 A0A1B0GW15 77 aa6.66□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 MALP21145 153 aa6.66□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 C2orf48Q96LS8 159 aa6.66□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 NAT8Q9UHE5 227 aa6.66□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.65□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 A0A0J9YXV3 536 aa6.65□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 KRTAP10-8P60410 259 aa6.65□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 ADIRFQ15847 76 aa6.65□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 Q6ZRP5 223 aa6.65□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 Q6ZUT4 128 aa6.65□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM104AQ969W3 186 aa6.65□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM18Q96B42 140 aa6.65□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.65□□□□□ -1.34
PDXDC1-211ENST00000565362 RNF213Q63HN8 5207 aa6.65□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 A0A1W2PNN7 141 aa6.64□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 TCAPO15273 167 aa6.64□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 APOMO95445 188 aa6.64□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 CKS2P33552 79 aa6.64□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 GAGE2BQ13066 116 aa6.64□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 C5orf38Q86SI9 138 aa6.64□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.64□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 A0A1B0GXF2 115 aa6.63□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 TNFRSF6BO95407 300 aa6.63□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 PEA15Q15121 130 aa6.63□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 RNF151Q2KHN1 245 aa6.63□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 REG3GQ6UW15 175 aa6.63□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.63□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.62□□□□□ -1.35
PDXDC1-211ENST00000565362 A0A1B0GVG6 124 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87 ms