RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.27□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 F5H697 171 aa6.27□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 VCYO14598 125 aa6.27□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 SCGB1D1O95968 90 aa6.27□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 DDTP30046 118 aa6.27□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 AMTP48728 403 aa6.27□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 ST20Q9HBF5 79 aa6.27□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.27□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 A0A096LNJ9 63 aa6.26□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.26□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 G0S2P27469 103 aa6.26□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.26□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.26□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.26□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.25□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 C20orf202A1L168 122 aa6.25□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.25□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 K7EP13 123 aa6.25□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 HBDP02042 147 aa6.25□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 FCER1GP30273 86 aa6.25□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 LAGE3Q14657 143 aa6.25□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.25□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF479Q96JC4 524 aa6.25□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 KIR2DL4Q99706 377 aa6.25□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.25□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 K7EQD1 137 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 PAX4O43316 350 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 LEPROTL1O95214 131 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 RHOHQ15669 191 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 PMCHL1Q16048 86 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 C14orf144Q96I85 54 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 I3L3M4 83 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 FHL2Q14192 279 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 Q8N814 137 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 PRO1933Q9H354 126 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 NPSP0C0P6 89 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00694P0DN24 101 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 TOMM6Q96B49 74 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMAD3-215ENST00000560424 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 ATP5LO75964 103 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 TSHBP01222 138 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 C3orf79P0CE67 100 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 KRTDAPP60985 99 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2D3P61077 147 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2D2P62837 147 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 PET117Q6UWS5 81 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 VAMP8Q9BV40 100 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 PRO0255Q9UI72 69 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 CRYBA4P53673 196 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 Q8N976 141 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 TIMM17AQ99595 171 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 ERASQ7Z444 233 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 Q9HAA7 133 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 Q9UF83 564 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 IGIPA6NJ69 53 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 M0R143 59 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 COTL1Q14019 142 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01545Q5VT33 79 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZSA8 131 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 SCXQ7RTU7 201 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM141Q96I45 108 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 H7C423 109 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.17□□□□□ -1.42
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