RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 TMEM101Q96IK0 257 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 BTF3L4Q96K17 158 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 F8W036 122 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 FCER1GP30273 86 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 CKS2P33552 79 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 C20orf78Q9BR46 151 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 D6R8Y8 96 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 TNFRSF6BO95407 300 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 SLPIP03973 132 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 FOXI1Q12951 378 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.43□□□□□ -0.58
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CS-219ENST00000550655 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 NPYP01303 97 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 ADCYAP1P18509 176 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 MT-ND4LP03901 98 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 ZNF664Q8N3J9 261 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 CCL25O15444 150 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 PPBPP02775 128 aa11.4□□□□□ -0.58
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CS-219ENST00000550655 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
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CS-219ENST00000550655 PHOX2AO14813 284 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 XCL1P47992 114 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 UQCC3Q6UW78 93 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 CFAP161Q6P656 301 aa11.38□□□□□ -0.59
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CS-219ENST00000550655 Q6ZUT4 128 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 TIMM21Q9BVV7 248 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
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CS-219ENST00000550655 SS18Q15532 418 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.36□□□□□ -0.59
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CS-219ENST00000550655 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
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CS-219ENST00000550655 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 FAM104AQ969W3 186 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 TMEM18Q96B42 140 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-219ENST00000550655 MYCBP2O75592 4640 aa11.34□□□□□ -0.59
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CS-219ENST00000550655 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 PRSS47A8MTI9 375 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 IMMP2LQ96T52 175 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 CHTF8P0CG12 524 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 COMMD7Q86VX2 200 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 SEC11CQ9BY50 192 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
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CS-219ENST00000550655 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 MAP1LC3AQ9H492 121 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 COX6A2Q02221 97 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-219ENST00000550655 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 COX7A2LO14548 114 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 RAB5AP20339 215 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 Q8N8P6 123 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 CARD19Q96LW7 228 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
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CS-219ENST00000550655 MALP21145 153 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 C5orf38Q86SI9 138 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.24□□□□□ -0.61
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CS-219ENST00000550655 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 A0A096LNI7 61 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 IFITM10A6NMD0 228 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-219ENST00000550655 SYCNQ0VAF6 134 aa11.23□□□□□ -0.61
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