RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550446.5

LETMD1-224, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	LINC00862	A6NCI5	91 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	CEBPG	P53567	150 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	ST20	Q9HBF5	79 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	RNF213	Q63HN8	5207 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	LINC01600	Q96MT4	127 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	TSHB	P01222	138 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	ESD	P10768	282 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	PEA15	Q15121	130 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	SS18	Q15532	418 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	COMMD7	Q86VX2	200 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	BORCS7	Q96B45	105 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	LRP2	P98164	4655 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	MRAP2	Q96G30	205 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-224	ENST00000550446	ODF1	Q14990	250 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	CARD19	Q96LW7	228 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446		A0A1B0GUT8	65 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	SYCN	Q0VAF6	134 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	CT83	Q5H943	113 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	HIGD1C	A8MV81	97 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	RAB4A	P20338	218 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF727	A8MUV8	499 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	ADCYAP1	P18509	176 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	TSKU	Q8WUA8	353 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446		A0A0J9YXV3	536 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	MAL	P21145	153 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	UQCC3	Q6UW78	93 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	AMN1	Q8IY45	258 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LETMD1-224	ENST00000550446	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	SMKR1	H3BMG3	65 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	VCY	O14598	125 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	FCER1G	P30273	86 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	CAMP	P49913	170 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	GAGE2B	Q13066	116 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	REG3G	Q6UW15	175 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446		Q6ZRP5	223 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	KRTAP10-8	P60410	259 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	11.76	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	TMEM218	A2RU14	115 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	PTTG1IP	P53801	180 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	ISOC2	Q96AB3	205 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	COX7A2L	O14548	114 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		11.73	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	RIG	Q13278	110 aa		11.73	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		11.73	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	NAT8	Q9UHE5	227 aa		11.73	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446		A0A1W2PNN7	141 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	C5orf38	Q86SI9	138 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	NUP35	Q8NFH5	326 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	PPP1R17	O96001	155 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	NRAC	Q8N912	160 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-224	ENST00000550446	ADIRF	Q15847	76 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446		V9GYV3	84 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	APOM	O95445	188 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	SEC11C	Q9BY50	192 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446		F8W036	122 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446		Q6ZUT4	128 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	C2orf48	Q96LS8	159 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	PPP1R2P9	O14990	202 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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