RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536509.5

LMO3-214, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-214ENST00000536509 BTF3L4Q96K17 158 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 RAB19A4D1S5 217 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 FGF6P10767 208 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 FOXI1Q12951 378 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 RGS21Q2M5E4 152 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 TMEM101Q96IK0 257 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 CARD19Q96LW7 228 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 SMLR1H3BR10 107 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 Q6ZNX1 250 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 MED9Q9NWA0 146 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-214ENST00000536509 LRP2P98164 4655 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 I3L3M4 83 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 XCL1P47992 114 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 ISOC2Q96AB3 205 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 SYCNQ0VAF6 134 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 SS18Q15532 418 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 FAM231BA6NCW3 169 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 CCL25O15444 150 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 BCL2P10415 239 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 PMCHP20382 165 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 MRAP2Q96G30 205 aa6.87□□□□□ -1.31
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LMO3-214ENST00000536509 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 CAMPP49913 170 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.85□□□□□ -1.31
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LMO3-214ENST00000536509 ST20Q9HBF5 79 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 A8MWL6 223 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 OCC1Q8TAD7 63 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 BORCS7Q96B45 105 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 RNF213Q63HN8 5207 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-214ENST00000536509 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 K7EN84 100 aa6.83□□□□□ -1.32
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LMO3-214ENST00000536509 GAS8-AS1O95177 125 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 APOMO95445 188 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 TSHBP01222 138 aa6.83□□□□□ -1.32
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LMO3-214ENST00000536509 GAGE2BQ13066 116 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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LMO3-214ENST00000536509 MT-ND6P03923 174 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 NUP35Q8NFH5 326 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 TSKUQ8WUA8 353 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 C2orf48Q96LS8 159 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 TMEM250H0YL14 139 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 PPP1R17O96001 155 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 A0A1B0GUT8 65 aa6.8□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 F8WDY8 70 aa6.8□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 VCYO14598 125 aa6.8□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 DIRC1Q969H9 104 aa6.8□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 A0A1W2PNN7 141 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 FCER1GP30273 86 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 C1orf137Q5JT78 98 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 SLC51BQ86UW2 128 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 TMEM18Q96B42 140 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 KIR2DL4Q99706 377 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-214ENST00000536509 HIGD1CA8MV81 97 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-214ENST00000536509 PPP1R2P9O14990 202 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-214ENST00000536509 RAB4AP20338 218 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-214ENST00000536509 IMMP2LQ96T52 175 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-214ENST00000536509 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-214ENST00000536509 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-214ENST00000536509 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-214ENST00000536509 TCAPO15273 167 aa6.76□□□□□ -1.33
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