RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524318.3

SFTPC-211, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

TSL 3

Gene SFTPC, Length 993 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-211ENST00000524318 PHOX2AO14813 284 aa6.6□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 CCL25O15444 150 aa6.6□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 MT1HL1P0DM35 61 aa6.6□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 RAB4AP20338 218 aa6.6□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 MRAP2Q96G30 205 aa6.6□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 OSTCQ9NRP0 149 aa6.6□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.59□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 SS18Q15532 418 aa6.59□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 AMN1Q8IY45 258 aa6.59□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 STPG4Q8N801 248 aa6.59□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.59□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.59□□□□□ -1.35
SFTPC-211ENST00000524318 A0A096LNI7 61 aa6.58□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.58□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 RIGQ13278 110 aa6.58□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.58□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.58□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.58□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.57□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 SMKR1H3BMG3 65 aa6.57□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 VCYO14598 125 aa6.57□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 FCER1GP30273 86 aa6.57□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.57□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.57□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 V9GYV3 84 aa6.57□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.56□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 PPP1R17O96001 155 aa6.56□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.56□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 NUP35Q8NFH5 326 aa6.56□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 CARD19Q96LW7 228 aa6.56□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.56□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.55□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 SYCNQ0VAF6 134 aa6.55□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 ISOC2Q96AB3 205 aa6.55□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 KIR2DL4Q99706 377 aa6.55□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 MALP21145 153 aa6.54□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.54□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.54□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 NRACQ8N912 160 aa6.54□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.54□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.54□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.53□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.53□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 COX7A2LO14548 114 aa6.53□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 PPP1R2P9O14990 202 aa6.53□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 CAMPP49913 170 aa6.53□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.53□□□□□ -1.36
SFTPC-211ENST00000524318 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.52□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.52□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 LINC00862A6NCI5 91 aa6.52□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 ADIRFQ15847 76 aa6.52□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM18Q96B42 140 aa6.52□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 LINC01600Q96MT4 127 aa6.52□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.51□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 C9JQL5 133 aa6.51□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 CKS2P33552 79 aa6.51□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 PTTG1IPP53801 180 aa6.51□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 GAGE2BQ13066 116 aa6.51□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.51□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 C5orf38Q86SI9 138 aa6.51□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.51□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 C20orf78Q9BR46 151 aa6.51□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.51□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 NAT8Q9UHE5 227 aa6.51□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 A0A1B0GW15 77 aa6.5□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 APOMO95445 188 aa6.5□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 PEA15Q15121 130 aa6.5□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 Q6ZRP5 223 aa6.5□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 Q6ZUT4 128 aa6.5□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 C2orf48Q96LS8 159 aa6.5□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 TCAPO15273 167 aa6.49□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 TNFRSF6BO95407 300 aa6.49□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 A0A0J9YXV3 536 aa6.48□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 A0A1B0GVG6 124 aa6.48□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 A0A1W2PNN7 141 aa6.48□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 REG3GQ6UW15 175 aa6.48□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.48□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 D6R8Y8 96 aa6.47□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 F8W036 122 aa6.47□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 S100A8P05109 93 aa6.47□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 KRTAP10-8P60410 259 aa6.47□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 HBBP68871 147 aa6.47□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 SPAG11BQ08648 103 aa6.47□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SFTPC-211ENST00000524318 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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