RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524152.5

MSC-AS1-210, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene MSC-AS1, Length 571 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM231BA6NCW3 169 aa5.9□□□□□ -1.46
MSC-AS1-210ENST00000524152 CCL25O15444 150 aa5.9□□□□□ -1.46
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.9□□□□□ -1.46
MSC-AS1-210ENST00000524152 CARD19Q96LW7 228 aa5.9□□□□□ -1.46
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A0J9YXV3 536 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 A8MWL6 223 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM250H0YL14 139 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 TSHBP01222 138 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 ESDP10768 282 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 MRAP2Q96G30 205 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM210AQ96ND0 272 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 ST20Q9HBF5 79 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.89□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.88□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 GAS8-AS1O95177 125 aa5.88□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 SYCNQ0VAF6 134 aa5.88□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 ODF1Q14990 250 aa5.88□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 SS18Q15532 418 aa5.88□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 CT83Q5H943 113 aa5.88□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 REG3GQ6UW15 175 aa5.88□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 BORCS7Q96B45 105 aa5.88□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.88□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 LPAP08519 4548 aa5.87□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.87□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q6ZRP5 223 aa5.87□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.87□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.87□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A1B0GUT8 65 aa5.86□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.86□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 HIGD1CA8MV81 97 aa5.86□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 CAMPP49913 170 aa5.86□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 CEBPGP53567 150 aa5.86□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 PTTG1IPP53801 180 aa5.86□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP10-8P60410 259 aa5.86□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 TSKUQ8WUA8 353 aa5.86□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 ISOC2Q96AB3 205 aa5.86□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.85□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 COX7A2LO14548 114 aa5.85□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 RAB4AP20338 218 aa5.85□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 MALP21145 153 aa5.85□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 MUC2Q02817 5179 aa5.84□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.84□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.84□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 VCYO14598 125 aa5.84□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 FCER1GP30273 86 aa5.84□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 BLOC1S1P78537 153 aa5.84□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 GAGE2BQ13066 116 aa5.84□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC01551Q86U37 167 aa5.84□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 AMN1Q8IY45 258 aa5.84□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.84□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
MSC-AS1-210ENST00000524152 SMKR1H3BMG3 65 aa5.83□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 APOMO95445 188 aa5.83□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 PPP1R17O96001 155 aa5.83□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.83□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.83□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 AKAP14Q86UN6 197 aa5.83□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 NUP35Q8NFH5 326 aa5.83□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.83□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.83□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.82□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A1W2PNN7 141 aa5.82□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 RIGQ13278 110 aa5.82□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 NRACQ8N912 160 aa5.82□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 C2orf48Q96LS8 159 aa5.82□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 KIR2DL4Q99706 377 aa5.82□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 OSTCQ9NRP0 149 aa5.82□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZNF727A8MUV8 499 aa5.81□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 MT-ND6P03923 174 aa5.81□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 C5orf38Q86SI9 138 aa5.81□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.81□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 PPP1R2P9O14990 202 aa5.8□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 SPAG11BQ08648 103 aa5.8□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q6ZUT4 128 aa5.8□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.8□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 V9GYV3 84 aa5.8□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 C1orf137Q5JT78 98 aa5.79□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.79□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM18Q96B42 140 aa5.79□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.79□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 RNF151Q2KHN1 245 aa5.78□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms