RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183		K7EQD1	137 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183		A0A087WX48	190 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	CIDEA	O60543	219 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	DPM2	O94777	84 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	IGKC	P01834	107 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	GAGE1	Q13065	139 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	GAGE4	Q13068	117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	GAGE5	Q13069	117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	COTL1	Q14019	142 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	DEFB4A	O15263	64 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	UBE2D3	P61077	147 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	UBE2D2	P62837	147 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	FHL2	Q14192	279 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	STPG4	Q8N801	248 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183		Q8NAQ8	132 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183		F8VRH5	84 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	RTL8C	O15255	209 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	PLN	P26678	52 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	PMVK	Q15126	192 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	TRIAP1	O43715	76 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183		Q8N1X5	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	AGRN	O00468	2067 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	COX8A	P10176	69 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	NMU	P48645	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	DAD1	P61803	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183		Q6ZTC4	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183		M0R2N4	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	NPS	P0C0P6	89 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	CRYBA4	P53673	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183		Q6ZR54	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	VCX2	Q9H322	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RACK1-231	ENST00000514183	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms