RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 A0A087WZ39 114 aa9.62□□□□□ -0.87
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SH3BP2-215ENST00000510074 NUP35Q8NFH5 326 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP2-215ENST00000510074 C11orf52Q96A22 123 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP2-215ENST00000510074 MANBALQ9NQG1 85 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP2-215ENST00000510074 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.61□□□□□ -0.87
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SH3BP2-215ENST00000510074 COX7A2LO14548 114 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-215ENST00000510074 UBE2D1P51668 147 aa9.6□□□□□ -0.87
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SH3BP2-215ENST00000510074 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.54□□□□□ -0.88
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SH3BP2-215ENST00000510074 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.53□□□□□ -0.88
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SH3BP2-215ENST00000510074 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.51□□□□□ -0.89
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SH3BP2-215ENST00000510074 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-215ENST00000510074 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.48□□□□□ -0.89
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SH3BP2-215ENST00000510074 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.44□□□□□ -0.9
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SH3BP2-215ENST00000510074 Q6ZUT4 128 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP2-215ENST00000510074 A0A1B0GUT8 65 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF861PO60384 105 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP2-215ENST00000510074 AMN1Q8IY45 258 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP2-215ENST00000510074 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP2-215ENST00000510074 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP2-215ENST00000510074 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-215ENST00000510074 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.4□□□□□ -0.9
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