RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 OCC1Q8TAD7 63 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 XCL1P47992 114 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 FOXI1Q12951 378 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 REG3GQ6UW15 175 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 FAM210AQ96ND0 272 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 A0A096LNI7 61 aa7.53□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.53□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 SS18Q15532 418 aa7.53□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.53□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 TNXBP22105 4242 aa7.53□□□□□ -1.2
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.52□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 A8MWL6 223 aa7.52□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.52□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 K7EN84 100 aa7.52□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 CCL25O15444 150 aa7.52□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 BORCS7Q96B45 105 aa7.52□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 CARD19Q96LW7 228 aa7.52□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 ST20Q9HBF5 79 aa7.52□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 A0A0J9YXV3 536 aa7.51□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.51□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 FAM231BA6NCW3 169 aa7.51□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 SYCNQ0VAF6 134 aa7.51□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZRP5 223 aa7.51□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 SLC51BQ86UW2 128 aa7.51□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 MRAP2Q96G30 205 aa7.51□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 ESDP10768 282 aa7.5□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.5□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.5□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM250H0YL14 139 aa7.49□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP10-8P60410 259 aa7.49□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.49□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.49□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 ISOC2Q96AB3 205 aa7.49□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.49□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 TSHBP01222 138 aa7.48□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 MALP21145 153 aa7.48□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.48□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.48□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.47□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1B0GUT8 65 aa7.47□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.47□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 CAMPP49913 170 aa7.47□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 CEBPGP53567 150 aa7.47□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 GAGE2BQ13066 116 aa7.47□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 CT83Q5H943 113 aa7.47□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.47□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.47□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 LRP2P98164 4655 aa7.46□□□□□ -1.21
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.46□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.46□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 COX7A2LO14548 114 aa7.46□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 VCYO14598 125 aa7.46□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 FCER1GP30273 86 aa7.46□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 PTTG1IPP53801 180 aa7.46□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 BLOC1S1P78537 153 aa7.46□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 RNF213Q63HN8 5207 aa7.46□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.45□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 HIGD1CA8MV81 97 aa7.45□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 GAS8-AS1O95177 125 aa7.45□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 PPP1R17O96001 155 aa7.45□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 RAB4AP20338 218 aa7.45□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 ODF1Q14990 250 aa7.45□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 TSKUQ8WUA8 353 aa7.45□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.44□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 APOMO95445 188 aa7.43□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 RIGQ13278 110 aa7.43□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 AMN1Q8IY45 258 aa7.43□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 NUP35Q8NFH5 326 aa7.43□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 C2orf48Q96LS8 159 aa7.43□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 KIR2DL4Q99706 377 aa7.43□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.43□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.42□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1W2PNN7 141 aa7.42□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 MT-ND6P03923 174 aa7.42□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM18Q96B42 140 aa7.42□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 OSTCQ9NRP0 149 aa7.42□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF727A8MUV8 499 aa7.41□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.41□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 C5orf38Q86SI9 138 aa7.41□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 LINC01551Q86U37 167 aa7.41□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.41□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 SMKR1H3BMG3 65 aa7.4□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 PPP1R2P9O14990 202 aa7.4□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.4□□□□□ -1.22
CNOT4-211ENST00000498534 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 RNF151Q2KHN1 245 aa7.39□□□□□ -1.23
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