RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497121.1

CPS1-208, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, human

TSL 4

Gene CPS1, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPS1-208	ENST00000497121	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	APCS	P02743	223 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	PMCH	P20382	165 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	FOXI1	Q12951	378 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	SVBP	Q8N300	66 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	NRAC	Q8N912	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	RIG	Q13278	110 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	VCY	O14598	125 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	SNAPIN	O95295	136 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	APOC3	P02656	99 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121		A0A087WYN8	130 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121		A0A1B0GXF2	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	SCO1	O75880	301 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	OXT	P01178	125 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	PEA15	Q15121	130 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	ADIRF	Q15847	76 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPS1-208	ENST00000497121	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121		F8W036	122 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	CCL25	O15444	150 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	XCL1	P47992	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	COX6A2	Q02221	97 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121		A0A1B0GW15	77 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	PPP1R17	O96001	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	CAMP	P49913	170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	FCER1G	P30273	86 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	SS18	Q15532	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121		A0A096LNI7	61 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121		D6R8Y8	96 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	NPY	P01303	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	CKS2	P33552	79 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	HBB	P68871	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121		Q6ZUT4	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	LRP2	P98164	4655 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	PHOX2A	O14813	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPS1-208	ENST00000497121	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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