RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.24□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 M0QY20 66 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 BSPH1Q075Z2 132 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF843Q8N446 348 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 A0A087WYN8 130 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 NCR3O14931 201 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV1-69P01742 117 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 C9orf85Q96MD7 179 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 SLPIP03973 132 aa6.22□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 CD28P10747 220 aa6.22□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 ITPR1Q14643 2758 aa6.22□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.22□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 PRM2P04554 102 aa6.22□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.22□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.22□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.22□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM243Q9BU79 118 aa6.22□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.22□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 COX6A2Q02221 97 aa6.21□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 SS18Q15532 418 aa6.21□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.21□□□□□ -1.41
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.21□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 GHRHP01286 108 aa6.21□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 NPBQ8NG41 125 aa6.21□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV3-20P01619 116 aa6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 IL17DQ8TAD2 202 aa6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 BRK1Q8WUW1 75 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 Q9H8V8 135 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 SNURFQ9Y675 71 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 EPM2AB3EWF7 344 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 H7BZZ5 65 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 PPP1R17O96001 155 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 DNAL4O96015 105 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 XCL1P47992 114 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 LINC01560Q8TB33 94 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 XCL2Q9UBD3 114 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 ATP6V0E1O15342 81 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 Q6JHZ5 121 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 DPM3Q9P2X0 92 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 AKAP9Q99996 3911 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 CCL21O00585 134 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF415Q09FC8 603 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 ENHOQ6UWT2 76 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 RMI2Q96E14 147 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 KNCNA6PVL3 124 aa6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 SOCS3O14543 225 aa6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 RNF5Q99942 180 aa6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 U3KQE9 123 aa6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZSN1 163 aa6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 NUP37Q8NFH4 326 aa6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 J3QKU1 62 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 PLA2G2AP14555 144 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 POLQO75417 2590 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 E7EQL1 145 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 PRB1P04280 392 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 Q8N9W7 124 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 CREBBPQ92793 2442 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.15□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 C1orf195Q5TG92 126 aa6.15□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.15□□□□□ -1.42
VWA3B-220ENST00000495571 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.15□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 HTN1P15515 57 aa6.15□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.15□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.15□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 V9GYY9 64 aa6.15□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms