RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.74□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.75□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 SPEF2Q9C093 1822 aa-0.75□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.75□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.75□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 NPFFO15130 113 aa-0.75□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 CCL8P80075 99 aa-0.75□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 SCIMPQ6UWF3 145 aa-0.75□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 SPTSSAQ969W0 71 aa-0.75□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 PXDNQ92626 1479 aa-0.75□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-0.76□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.76□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.76□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFB6O95139 128 aa-0.76□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 CCL18P55774 89 aa-0.76□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 S100A7L2Q5SY68 101 aa-0.76□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 SCN3BQ9NY72 215 aa-0.76□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 K7ERU9 68 aa-0.77□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 ALX1Q15699 326 aa-0.77□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.77□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 Q8IZM0 81 aa-0.77□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-0.77□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 AKAP13Q12802 2813 aa-0.77□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.77□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 LRP6O75581 1613 aa-0.78□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM6P0DI80 62 aa-0.78□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 SPRR1AP35321 89 aa-0.78□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.78□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 DOCK1Q14185 1865 aa-0.78□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.78□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 IFT140Q96RY7 1462 aa-0.79□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 PATJQ8NI35 1801 aa-0.79□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF236Q9UL36 1845 aa-0.79□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 BCE1O60756 84 aa-0.79□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 SNCGO76070 127 aa-0.79□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 SDF2Q99470 211 aa-0.79□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.79□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 RELNP78509 3460 aa-0.79□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.79□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 MTORP42345 2549 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 PI4KAP42356 2102 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 MT1AP04731 61 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 MT1HP80294 61 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 SPAG11BQ08648 103 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 TSTD1Q8NFU3 115 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 NPVFQ9HCQ7 196 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 LYSTQ99698 3801 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.8□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 SIX6O95475 246 aa-0.81□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 MT1XP80297 61 aa-0.81□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 LZICQ8WZA0 190 aa-0.81□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 SEC11CQ9BY50 192 aa-0.81□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.81□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 MRC1P22897 1456 aa-0.81□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 TACC2O95359 2948 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 AKAP9Q99996 3911 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 KCNRGQ8N5I3 272 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 COPZ2Q9P299 210 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 ATRQ13535 2644 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 BCL9LQ86UU0 1499 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 DOCK2Q92608 1830 aa-0.82□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.83□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 TEX15Q9BXT5 2789 aa-0.83□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 HCG22E2RYF7 251 aa-0.83□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 PPP1R17O96001 155 aa-0.83□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 MT1BP07438 61 aa-0.83□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.83□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM21Q3B7S5 101 aa-0.83□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-0.83□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.83□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.84□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.84□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 I3L2K1 104 aa-0.84□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 M0R135 149 aa-0.84□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 COPZ1P61923 177 aa-0.84□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.84□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 R4GMQ9 66 aa-0.84□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms