RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-210ENST00000489601 MRAP2Q96G30 205 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-210ENST00000489601 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-210ENST00000489601 BLOC1S1P78537 153 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-210ENST00000489601 SS18Q15532 418 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-210ENST00000489601 CARD19Q96LW7 228 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM242Q9NWH2 141 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-210ENST00000489601 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 CD164L2Q6UWJ8 174 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 BORCS7Q96B45 105 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC00526Q96FQ7 95 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM191AQ9H0A3 160 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A0J9YXV3 536 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A1B0GUT8 65 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF664Q8N3J9 261 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 HIGD1CA8MV81 97 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB4AP20338 218 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 SYCNQ0VAF6 134 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 TSKUQ8WUA8 353 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 C7orf77A4D0Y5 90 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 KRTAP10-8P60410 259 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 REG3GQ6UW15 175 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 Q6ZRP5 223 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 CAMPP49913 170 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 CEBPGP53567 150 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 OSTCQ9NRP0 149 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 PTTG1IPP53801 180 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ALKAL2Q6UX46 152 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC01551Q86U37 167 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 AMN1Q8IY45 258 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ISOC2Q96AB3 205 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 C1orf196B1AJZ1 125 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 VCYO14598 125 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP1R17O96001 155 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 MALP21145 153 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 SMAGPQ0VAQ4 97 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 ODF1Q14990 250 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 COX7A2LO14548 114 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 FCER1GP30273 86 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 GAGE2BQ13066 116 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 RIGQ13278 110 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 NUP35Q8NFH5 326 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF727A8MUV8 499 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 SMKR1H3BMG3 65 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 NRACQ8N912 160 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 C2orf48Q96LS8 159 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 V9GYV3 84 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A1W2PNN7 141 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 KIR2DL4Q99706 377 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP1R2P9O14990 202 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 APOMO95445 188 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 SRP19P09132 144 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 AKAP14Q86UN6 197 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 TIMM21Q9BVV7 248 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM18Q96B42 140 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 C5orf38Q86SI9 138 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 NAT8BQ9UHF3 227 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC00862A6NCI5 91 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF151Q2KHN1 245 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM104BQ5XKR9 115 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 Q6ZUT4 128 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 RPL32P62910 135 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 C20orf78Q9BR46 151 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF213Q63HN8 5207 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 TCAPO15273 167 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 SPAG11BQ08648 103 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM74A3Q4VXF1 159 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 OR10D4PQ8NGN7 298 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 F8WDY8 70 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 MT-ND6P03923 174 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 RPL23P62829 140 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM104AQ969W3 186 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A1B0GW15 77 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-210ENST00000489601 CKS2P33552 79 aa10.14□□□□□ -0.79
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