RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489114.1

PTPRZ1-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRZ1, Length 571 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-209ENST00000489114 K7ERU9 68 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 DR1Q01658 176 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 SMIM21Q3B7S5 101 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 C10orf128Q5T292 105 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 Q6AWC8 147 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 Q6JHZ5 121 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 TSTD1Q8NFU3 115 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 TSLPQ969D9 159 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 NPVFQ9HCQ7 196 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 PAPPAQ13219 1627 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 PRDM2Q13029 1718 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 IGLC7A0M8Q6 106 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 SNCGO76070 127 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 SPRR2AP35326 72 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 COPZ1P61923 177 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 KCNRGQ8N5I3 272 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 R4GMQ9 66 aa-0.55□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 F8VRH5 84 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 J3QR89 54 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 COX6B1P14854 86 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 SPRR2EP22531 72 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 SPANXDQ9BXN6 97 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-0.56□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 CREBBPQ92793 2442 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 CEP152O94986 1710 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 HMGN4O00479 90 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 UQCR11O14957 56 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 NDUFA2O43678 99 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 MT4P47944 62 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 SERP1Q9Y6X1 66 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 PATJQ8NI35 1801 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 BICRAQ9NZM4 1560 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 PKD1P98161 4303 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.58□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 M0R2T5 61 aa-0.58□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 SMCO1Q147U7 214 aa-0.58□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 RERGLQ9H628 205 aa-0.58□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-0.58□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.58□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 COPZ2Q9P299 210 aa-0.58□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 V9GYH0 126 aa-0.58□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 CFTRP13569 1480 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 MBD5Q9P267 1494 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 GNG7O60262 68 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 SMIM6P0DI80 62 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 ARPC4P59998 168 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 BTG2P78543 158 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 MEIG1Q5JSS6 88 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 LYSTQ99698 3801 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 MGST2Q99735 147 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 PDCD10Q9BUL8 212 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 LINC00470Q9BZP3 86 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 TACC2O95359 2948 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.59□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.6□□□□□ -2.5
PTPRZ1-209ENST00000489114 ARHGEF5Q12774 1597 aa-0.6□□□□□ -2.51
PTPRZ1-209ENST00000489114 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.6□□□□□ -2.51
PTPRZ1-209ENST00000489114 OOSP1A8MZH6 123 aa-0.6□□□□□ -2.51
PTPRZ1-209ENST00000489114 SFT2D2O95562 160 aa-0.6□□□□□ -2.51
PTPRZ1-209ENST00000489114 IGLC1P0CG04 106 aa-0.6□□□□□ -2.51
PTPRZ1-209ENST00000489114 SELENOWP63302 87 aa-0.6□□□□□ -2.51
PTPRZ1-209ENST00000489114 COX17Q14061 63 aa-0.6□□□□□ -2.51
PTPRZ1-209ENST00000489114 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
PTPRZ1-209ENST00000489114 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
PTPRZ1-209ENST00000489114 LCN9Q8WX39 176 aa-0.6□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms