RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 D6R8Y8 96 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 M0QY20 66 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 APCSP02743 223 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 S100A8P05109 93 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 RAB5AP20339 215 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 CKS2P33552 79 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 CRYBA4P53673 196 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 IQCJQ1A5X6 159 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GW15 77 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 IGLL5B9A064 214 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 NPYP01303 97 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-DQA1P01909 254 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 SRIP30626 198 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP12-2P59991 146 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 RASL11AQ6T310 242 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 PRELID3AQ96N28 172 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 C18orf15Q96N68 181 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 OCR1Q9BZK8 76 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 PRO0255Q9UI72 69 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 A8MU10 97 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 RHOHQ15669 191 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZR54 194 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 ORMDL3Q8N138 153 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 MRAP2Q96G30 205 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 PRADC1Q9BSG0 188 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 ST20Q9HBF5 79 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 NIT2Q9NQR4 276 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 H7C1H1 209 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 PHOX2AO14813 284 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 TCAPO15273 167 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 MT-ND6P03923 174 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 COX19Q49B96 90 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 MUC7Q8TAX7 377 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 NUPR1O60356 82 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2BKO60814 126 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 PPBPP02775 128 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2BJP06899 126 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 PMCHP20382 165 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2BOP23527 126 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2BBP33778 126 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2BDP58876 126 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2D3P61077 147 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2BCP62807 126 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2D2P62837 147 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 ESRGQ1W209 222 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 NIT1Q86X76 327 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 APLNQ9ULZ1 77 aa3.2□□□□□ -1.9
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PTPRC-211ENST00000484135 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 NUPR2A6NF83 97 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 H0Y8G0 127 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 I3L3M4 83 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00694P0DN24 101 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFA6P56556 154 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 PMCHL1Q16048 86 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 CASC10Q5T4H9 136 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
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