RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	SCX	Q7RTU7	201 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GXF2	115 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	CCL25	O15444	150 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	SS18	Q15532	418 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	CFAP161	Q6P656	301 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	NPY	P01303	97 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZSA8	131 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM18	Q96B42	140 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf78	Q9BR46	151 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	IFITM2	Q01629	132 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	ORMDL3	Q8N138	153 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	DPH3	Q96FX2	82 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	PPBP	P02775	128 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	9.58	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	PRELID3A	Q96N28	172 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	TCAP	O15273	167 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	RAB5A	P20339	215 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	UQCC3	Q6UW78	93 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	COMMD7	Q86VX2	200 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	C15orf56	Q8N910	161 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	9.56	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	FOXI1	Q12951	378 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZUT4	128 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	9.55	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM218	A2RU14	115 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	MAL	P21145	153 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	9.55	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	PHOX2A	O14813	284 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	ADCYAP1	P18509	176 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	SLPI	P03973	132 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	9.53	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	9.53	□□□□□ -0.88
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	CHTF8	P0CG12	524 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	9.52	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	9.51	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	COX7A2L	O14548	114 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	S100P	P25815	95 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	9.51	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	IFITM10	A6NMD0	228 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	PANO1	I0J062	215 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	9.5	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	COX6A2	Q02221	97 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	C5orf38	Q86SI9	138 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	SEC11C	Q9BY50	192 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	MYCBP2	O75592	4640 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	CARD19	Q96LW7	228 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	IMMP2L	Q96T52	175 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	MAJIN	Q3KP22	176 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N8P6	123 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SSR4-208	ENST00000471880	APOM	O95445	188 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	SYCN	Q0VAF6	134 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WYN8	130 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	HERC1	Q15751	4861 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	SPAG11B	Q08648	103 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		9.44	□□□□□ -0.9

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