RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470482.5

HDLBP-232, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 624 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-232ENST00000470482 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-232ENST00000470482 TNXBP22105 4242 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-232ENST00000470482 PMCHP20382 165 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-232ENST00000470482 CEBPGP53567 150 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-232ENST00000470482 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-232ENST00000470482 CFAP161Q6P656 301 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-232ENST00000470482 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-232ENST00000470482 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 SMKR1H3BMG3 65 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 VCYO14598 125 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 COX6A2Q02221 97 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 RIGQ13278 110 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 NAT8Q9UHE5 227 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 A0A1B0GXF2 115 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 CCL25O15444 150 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 Q6ZRU5 148 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 BORCS7Q96B45 105 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00862A6NCI5 91 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 PPP1R17O96001 155 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 XCL1P47992 114 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 C20orf78Q9BR46 151 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 A0A096LNI7 61 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 A0A1B0GW15 77 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 PEA15Q15121 130 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM101Q96IK0 257 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 BTF3L4Q96K17 158 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-232ENST00000470482 ADIRFQ15847 76 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 PRSS47A8MTI9 375 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 PHOX2AO14813 284 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 PPP1R2P9O14990 202 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 TNFRSF6BO95407 300 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 SS18Q15532 418 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 NPYP01303 97 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 CAMPP49913 170 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 SYCNQ0VAF6 134 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 MAJINQ3KP22 176 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 Q6ZUT4 128 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 STPG4Q8N801 248 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 KIR2DL4Q99706 377 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 FCER1GP30273 86 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 CKS2P33552 79 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 HBBP68871 147 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 D6R8Y8 96 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 PPBPP02775 128 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 PTTG1IPP53801 180 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 DPH3Q96FX2 82 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 C2orf48Q96LS8 159 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 CARD19Q96LW7 228 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-232ENST00000470482 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 A0A1W2PNN7 141 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 COX7A2LO14548 114 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 TCAPO15273 167 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 RNF151Q2KHN1 245 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 LINC01600Q96MT4 127 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 S100A8P05109 93 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP10-8P60410 259 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 C5orf38Q86SI9 138 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 F8W036 122 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 KIAA0087Q14695 138 aa7.25□□□□□ -1.25
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