RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.73□□□□□ -1.01
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C9orf3-210ENST00000462125 RMI2Q96E14 147 aa8.73□□□□□ -1.01
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C9orf3-210ENST00000462125 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.73□□□□□ -1.01
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C9orf3-210ENST00000462125 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.71□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 RNF185Q96GF1 192 aa8.7□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.7□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 MPV17L2Q567V2 206 aa8.69□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 C20orf202A1L168 122 aa8.68□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 LEPROTL1O95214 131 aa8.67□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 K7EMI3 77 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 TNFRSF6BO95407 300 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 NPYP01303 97 aa8.66□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GUV1 79 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 FAM229AH3BQW9 127 aa8.64□□□□□ -1.03
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C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 PET117Q6UWS5 81 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01549A6NIU2 74 aa8.63□□□□□ -1.03
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C9orf3-210ENST00000462125 C14orf177Q52M58 125 aa8.63□□□□□ -1.03
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C9orf3-210ENST00000462125 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.62□□□□□ -1.03
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C9orf3-210ENST00000462125 NRACQ8N912 160 aa8.62□□□□□ -1.03
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C9orf3-210ENST00000462125 TMEM243Q9BU79 118 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 VAMP8Q9BV40 100 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.61□□□□□ -1.03
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C9orf3-210ENST00000462125 LINC01620Q4KN68 170 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 TCAPO15273 167 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 REG3AQ06141 175 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 COTL1Q14019 142 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.59□□□□□ -1.03
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