RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 FA2HQ7L5A8 372 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 AMN1Q8IY45 258 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 RMI2Q96E14 147 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.73□□□□□ -1.01
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C9orf3-210ENST00000462125 D6R8Y8 96 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM262E9PQX1 116 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 MRAP2Q96G30 205 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 PPP1R17O96001 155 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 ENHOQ6UWT2 76 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 BAALCQ8WXS3 180 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 UBE2WQ96B02 151 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.71□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.7□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 SCGB1D1O95968 90 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 PKIAP61925 76 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.7□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 RNF185Q96GF1 192 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.7□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 MPV17L2Q567V2 206 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 C20orf202A1L168 122 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 PRSS47A8MTI9 375 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 TSTD3H0UI37 97 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 PRR34Q9NV39 138 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 LEPROTL1O95214 131 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 MGPP08493 103 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 KRTDAPP60985 99 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 PMCHL1Q16048 86 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZSA8 131 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01546A6NGU7 62 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 K7EMI3 77 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 TNFRSF6BO95407 300 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 NPYP01303 97 aa8.66□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 RBX1P62877 108 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 MIAQ16674 131 aa8.66□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.65□□□□□ -1.02
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C9orf3-210ENST00000462125 C20orf78Q9BR46 151 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GUV1 79 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 FAM229AH3BQW9 127 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 HBDP02042 147 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 CRPP02741 224 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 HAMPP81172 84 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE6Q13070 117 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 PET117Q6UWS5 81 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01549A6NIU2 74 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 NCR2O95944 276 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.63□□□□□ -1.03
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C9orf3-210ENST00000462125 C14orf177Q52M58 125 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.62□□□□□ -1.03
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C9orf3-210ENST00000462125 G0S2P27469 103 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 NRACQ8N912 160 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM243Q9BU79 118 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 VAMP8Q9BV40 100 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 FCER1GP30273 86 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01620Q4KN68 170 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 TCAPO15273 167 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 REG3AQ06141 175 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 COTL1Q14019 142 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.59□□□□□ -1.03
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