RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM231BA6NCW3 169 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 HIGD1CA8MV81 97 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 SMKR1H3BMG3 65 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 TSHBP01222 138 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 GAGE2BQ13066 116 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 CARD19Q96LW7 228 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.4□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB4AP20338 218 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 SYCNQ0VAF6 134 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 RIGQ13278 110 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 AMN1Q8IY45 258 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 TSKUQ8WUA8 353 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 VCYO14598 125 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 MT1HL1P0DM35 61 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 ESDP10768 282 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 CT83Q5H943 113 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF213Q63HN8 5207 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 COX7A2LO14548 114 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 CAMPP49913 170 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01551Q86U37 167 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 ISOC2Q96AB3 205 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 KIR2DL4Q99706 377 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 OSTCQ9NRP0 149 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R17O96001 155 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 ADIRFQ15847 76 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 REG3GQ6UW15 175 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 C5orf38Q86SI9 138 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 NUP35Q8NFH5 326 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM18Q96B42 140 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM210AQ96ND0 272 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 APOMO95445 188 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 CKS2P33552 79 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 ODF1Q14990 250 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZRP5 223 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 V9GYV3 84 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0J9YXV3 536 aa5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R2P9O14990 202 aa5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01600Q96MT4 127 aa5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1-204ENST00000459646 MT-ND6P03923 174 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 PTTG1IPP53801 180 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZUT4 128 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 NRACQ8N912 160 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1W2PNN7 141 aa5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 SPAG11BQ08648 103 aa5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 NAT8Q9UHE5 227 aa5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00862A6NCI5 91 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 TNFRSF6BO95407 300 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 PEA15Q15121 130 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 C1orf137Q5JT78 98 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 C2orf48Q96LS8 159 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 C20orf78Q9BR46 151 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1B0GW15 77 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 IFITM10A6NMD0 228 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 D6R8Y8 96 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 F8W036 122 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 TCAPO15273 167 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 S100A8P05109 93 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB5AP20339 215 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1-204ENST00000459646 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms