RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 C9orf163Q8N9P6 203 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-208ENST00000459627 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-208ENST00000459627 PANO1I0J062 215 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-208ENST00000459627 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
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SH3BP5-208ENST00000459627 XCL1P47992 114 aa15.39■□□□□ 0.05
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SH3BP5-208ENST00000459627 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
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SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM18Q96B42 140 aa15.25■□□□□ 0.03
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SH3BP5-208ENST00000459627 MAP1LC3AQ9H492 121 aa15.18■□□□□ 0.02
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SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1644Q3SXP7 199 aa15.17■□□□□ 0.02
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SH3BP5-208ENST00000459627 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.16■□□□□ 0.02
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SH3BP5-208ENST00000459627 SEC11CQ9BY50 192 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A096LNI7 61 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP5-208ENST00000459627 IFITM10A6NMD0 228 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP5-208ENST00000459627 PRSS47A8MTI9 375 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP5-208ENST00000459627 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP5-208ENST00000459627 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP5-208ENST00000459627 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP5-208ENST00000459627 Q8N8P6 123 aa15.14■□□□□ 0.01
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SH3BP5-208ENST00000459627 SYCNQ0VAF6 134 aa15.13■□□□□ 0.01
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