RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.34□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 I3L3M4 83 aa6.34□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 C1orf137Q5JT78 98 aa6.34□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 MRAP2Q96G30 205 aa6.34□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 TEX261Q6UWH6 196 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 CNFNQ9BYD5 112 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PNN7 141 aa6.32□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 TSHBP01222 138 aa6.32□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.32□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 ST20Q9HBF5 79 aa6.32□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 HMSDA8MTL9 139 aa6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 K7EN84 100 aa6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 COX7A2LO14548 114 aa6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 APOMO95445 188 aa6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 BORCS7Q96B45 105 aa6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.3□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 NUP35Q8NFH5 326 aa6.3□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.3□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 ESDP10768 282 aa6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 FCER1GP30273 86 aa6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 SPAG11BQ08648 103 aa6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 OCC1Q8TAD7 63 aa6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 DIRC1Q969H9 104 aa6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 A0A087WZ39 114 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 C5orf38Q86SI9 138 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-211ENST00000449757 A8MWL6 223 aa6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 IGLV7-43P04211 117 aa6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 CEBPGP53567 150 aa6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 PRR4Q16378 134 aa6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 C2orf48Q96LS8 159 aa6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 SMKR1H3BMG3 65 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 UBE2D1P51668 147 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 Q6ZUT4 128 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 H0Y9J4 135 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 AMN1Q8IY45 258 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 TSKUQ8WUA8 353 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0U1RQV1 116 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GUT8 65 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 FAM168BA1KXE4 195 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 UBE2BP63146 152 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 FAM210AQ96ND0 272 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 KIR2DL4Q99706 377 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 HIGD1CA8MV81 97 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 VCYO14598 125 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 NDUFA1O15239 70 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 RAB4AP20338 218 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 GAGE2EQ4V326 116 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 CT83Q5H943 113 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 AKAP14Q86UN6 197 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM18Q96B42 140 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 IMMP2LQ96T52 175 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 MUC2Q02817 5179 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 M0QXV9 152 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 RNF151Q2KHN1 245 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM250H0YL14 139 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 PPP1R2P9O14990 202 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 PPP1R17O96001 155 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 RIGQ13278 110 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 C10orf25Q5T742 122 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 SLC51BQ86UW2 128 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 IFITM10A6NMD0 228 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
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