RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 FCER1GP30273 86 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 KIR2DL4Q99706 377 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 C20orf78Q9BR46 151 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 hDV102S1A0JD36 115 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM229AH3BQW9 127 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 MT-ND4LP03901 98 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 IFITM2Q01629 132 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 D6R8Y8 96 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 TNFRSF6BO95407 300 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 UQCC3Q6UW78 93 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 SCXQ7RTU7 201 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 PPBPP02775 128 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 CFAP161Q6P656 301 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 J3QL48 77 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 PHOX2AO14813 284 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 TCAPO15273 167 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 C15orf56Q8N910 161 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 NPYP01303 97 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXI1Q12951 378 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 ORMDL3Q8N138 153 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM18Q96B42 140 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 CCL25O15444 150 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 ADCYAP1P18509 176 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 XCL1P47992 114 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 SS18Q15532 418 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM218A2RU14 115 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 SLPIP03973 132 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 PRELID3AQ96N28 172 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 Q6ZUT4 128 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 IMMP2LQ96T52 175 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 COMMD7Q86VX2 200 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 SEC11CQ9BY50 192 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB5AP20339 215 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 PRSS47A8MTI9 375 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 PANO1I0J062 215 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM104AQ969W3 186 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 COX7A2LO14548 114 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 CHTF8P0CG12 524 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 MALP21145 153 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 Q8N8P6 123 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 COX6A2Q02221 97 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 S100PP25815 95 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 CARD19Q96LW7 228 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A087WYN8 130 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 IFITM10A6NMD0 228 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 K7EMI3 77 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms