RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087WTM6 91 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 LEPROTL1O95214 131 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP10-1P60331 282 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 S100A12P80511 92 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q8N8P6 123 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYCBP2O75592 4640 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS47A8MTI9 375 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 H7C1H1 209 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSCAO43653 123 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTDAPP60985 99 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 HAMPP81172 84 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 PYY3Q5JQD4 70 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 NIT2Q9NQR4 276 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 K7EMI3 77 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 G0S2P27469 103 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF56Q15929 161 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 NRACQ8N912 160 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 ST20Q9HBF5 79 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAT1Q14517 4588 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 C20orf202A1L168 122 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAGE12JA6NER3 117 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 K7EP13 123 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 HBDP02042 147 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAGE1Q13065 139 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAGE4Q13068 117 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAGE5Q13069 117 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 LAGE3Q14657 143 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 LELP1Q5T871 98 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 C9orf118A6NHY6 69 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 VCYO14598 125 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 FCER1GP30273 86 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 PMCHL1Q16048 86 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC01546A6NGU7 62 aa7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 TCAPO15273 167 aa7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAS8-AS1O95177 125 aa7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 C3orf79P0CE67 100 aa7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBE2D3P61077 147 aa7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBE2D2P62837 147 aa7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC01549A6NIU2 74 aa7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 B5MCH6 92 aa7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 PET117Q6UWS5 81 aa7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIR2DL4Q99706 377 aa7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 M0QY20 66 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP5LO75964 103 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q8N3U1 123 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 TSTD3H0UI37 97 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 I3L3M4 83 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 VAMP8Q9BV40 100 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS1P07477 247 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 PKIAP61925 76 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 H0Y8G0 127 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV3-30P01768 117 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV3-33P01772 117 aa7.21□□□□□ -1.26
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