RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418800.6

DDR1-232, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene DDR1, Length 3,588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-232ENST00000418800 UQCRQO14949 82 aa8.67□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 C5orf47Q569G3 176 aa8.67□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.67□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.67□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.67□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 SIRPDQ9H106 197 aa8.67□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 Q9UF83 564 aa8.67□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 DEFB131AP59861 70 aa8.66□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.66□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 PEMTQ9UBM1 199 aa8.66□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 ITPR2Q14571 2701 aa8.66□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 FAM223BA6NKX1 122 aa8.66□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 LST1O00453 97 aa8.66□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.66□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.66□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.66□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.65□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.65□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.65□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 M0QY20 66 aa8.65□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 DEFB136Q30KP8 78 aa8.65□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 LINC00643Q86TS7 51 aa8.65□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.65□□□□□ -1.02
DDR1-232ENST00000418800 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 MIAQ16674 131 aa8.65□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.65□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 A0A1W2PPR1 153 aa8.64□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.64□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 AMELXQ99217 191 aa8.64□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 ATP5G1P05496 136 aa8.64□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.63□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 RNF223E7ERA6 249 aa8.63□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.63□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 CFHR3Q02985 330 aa8.63□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 EBI3Q14213 229 aa8.63□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.63□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 XCL2Q9UBD3 114 aa8.63□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 IGHV1-69P01742 117 aa8.62□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.62□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.62□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.62□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 C19orf84I3L1E1 186 aa8.62□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 TIRAPP58753 221 aa8.62□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.62□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 LINC00315P59091 139 aa8.62□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.62□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 ITPR3Q14573 2671 aa8.62□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 LINC00158P58513 81 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 USMG5Q96IX5 58 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 A0A087WW49 117 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 CRPP02741 224 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 PFN2P35080 140 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 U3KQE9 123 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.6□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.6□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 A0A1W2PRX2 142 aa8.6□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 SLPIP03973 132 aa8.6□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 COX7CP15954 63 aa8.6□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 LMO4P61968 165 aa8.6□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.6□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.6□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 Q8N2B8 174 aa8.6□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 ACYP1P07311 99 aa8.59□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.59□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 PAX4O43316 350 aa8.59□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 IGHV4-59P01825 116 aa8.59□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.59□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.59□□□□□ -1.03
DDR1-232ENST00000418800 ATOX1O00244 68 aa8.58□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 C4orf26Q17RF5 130 aa8.58□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.58□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 UBE2L6O14933 153 aa8.58□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.58□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 COX7A2LO14548 114 aa8.58□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.58□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 A0A0J9YX75 114 aa8.57□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.57□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.57□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.56□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.56□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 F5H768 121 aa8.56□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 NCR3O14931 201 aa8.56□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 KLLNB2CW77 178 aa8.56□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 LECT2O14960 151 aa8.56□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 MED14OSP0DP75 135 aa8.56□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 C20orf197Q8N268 126 aa8.56□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 SOCS3O14543 225 aa8.55□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 CCL19Q99731 98 aa8.55□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.55□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 SLURP1P55000 103 aa8.55□□□□□ -1.04
DDR1-232ENST00000418800 Q6ZSN1 163 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.2 ms