RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384269.1

RNU6-842P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 842, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-842P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-842P-201ENST00000384269 Q6ZUT4 128 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-842P-201ENST00000384269 AQP10Q96PS8 301 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-842P-201ENST00000384269 LENEPQ9Y5L5 61 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-842P-201ENST00000384269 MYH6P13533 1939 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-842P-201ENST00000384269 PKD1P98161 4303 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-842P-201ENST00000384269 DOCK1Q14185 1865 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-842P-201ENST00000384269 NSD3Q9BZ95 1437 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-842P-201ENST00000384269 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 PITX3O75364 302 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 APOC3P02656 99 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 DBIP07108 87 aaKnown RBP-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 C10orf128Q5T292 105 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 DDA1Q9BW61 102 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 GINS2Q9Y248 185 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 FAT3Q8TDW7 4589 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 TACC2O95359 2948 aa-1.86□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-1.86□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 DNAH3Q8TD57 4116 aa-1.86□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 FABP1P07148 127 aa-1.86□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 BAGE2Q86Y30 109 aa-1.86□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 AMELXQ99217 191 aa-1.86□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 UQCR11O14957 56 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 COX8AP10176 69 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 TAC4Q86UU9 113 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 SONP18583 2426 aaKnown RBP-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 ADGRB1O14514 1584 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 TPPP2P59282 170 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 DEFB112Q30KQ8 113 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 Q6AWC8 147 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 RYR1P21817 5038 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 IFT140Q96RY7 1462 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 HCG22E2RYF7 251 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 NCR2O95944 276 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 IFNGP01579 166 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 MORN2Q502X0 79 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 SPANXA1Q9NS26 97 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 OVOS2Q6IE36 1432 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 F8VRH5 84 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 IGLC6P0CF74 106 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 ALX1Q15699 326 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 SCIMPQ6UWF3 145 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 TTC9CQ8N5M4 171 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 APLNQ9ULZ1 77 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 DOCK2Q92608 1830 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 NBASA2RRP1 2371 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 J3QR89 54 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 RYR3Q15413 4870 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 DISP2A7MBM2 1401 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 USMG5Q96IX5 58 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 BIRC6Q9NR09 4857 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 AKAP9Q99996 3911 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 KIAA0556O60303 1618 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 SPEF2Q9C093 1822 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 PATJQ8NI35 1801 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 KCNRGQ8N5I3 272 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 SPRR2FQ96RM1 72 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 HTTP42858 3142 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 IGLC7A0M8Q6 106 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 ARPC5O15511 151 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 LINC00694P0DN24 101 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 NEFHP12036 1026 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 SMIM3Q9BZL3 60 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 AIF1LQ9BQI0 150 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-842P-201ENST00000384269 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-1.97□□□□□ -2.73
RNU6-842P-201ENST00000384269 HMGXB3Q12766 1538 aa-1.97□□□□□ -2.73
RNU6-842P-201ENST00000384269 KNL1Q8NG31 2342 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-842P-201ENST00000384269 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-842P-201ENST00000384269 K7ERU9 68 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-842P-201ENST00000384269 TSPAN19P0C672 248 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-842P-201ENST00000384269 C9orf62Q8N4C0 152 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-842P-201ENST00000384269 NAA60Q9H7X0 242 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-842P-201ENST00000384269 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-842P-201ENST00000384269 GSKIPQ9P0R6 139 aa-1.98□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.8 ms