RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa16.32■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 XGP55808 180 aa16.31■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 SMAGPQ0VAQ4 97 aa16.31■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 LINC01620Q4KN68 170 aa16.31■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa16.31■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa16.3■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 GAGE12HA6NDE8 117 aa16.3■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 PRSS1P07477 247 aa16.3■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF664Q8N3J9 261 aa16.3■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa16.3■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa16.3■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 S100PP25815 95 aa16.29■□□□□ 0.2
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CXCL2-201ENST00000296031 TMEM18Q96B42 140 aa16.29■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa16.29■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 CLRN3Q8NCR9 226 aa16.28■□□□□ 0.2
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CXCL2-201ENST00000296031 FAM30AQ9NZY2 134 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa16.26■□□□□ 0.19
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CXCL2-201ENST00000296031 TIMM21Q9BVV7 248 aa16.26■□□□□ 0.19
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CXCL2-201ENST00000296031 Q8N1X5 172 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 MAP1LC3AQ9H492 121 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 RPS10P5Q9NQ39 176 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 RPL39P62891 51 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
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CXCL2-201ENST00000296031 hDV102S1A0JD36 115 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 XCL1P47992 114 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 SS18Q15532 418 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 CCL25O15444 150 aa16.22■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 CFAP161Q6P656 301 aa16.22■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 Q6ZUT4 128 aa16.22■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 APOC3P02656 99 aa16.21■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 FOXI1Q12951 378 aa16.21■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 Q6ZSA8 131 aa16.21■□□□□ 0.19
CXCL2-201ENST00000296031 Q8N8P6 123 aa16.2■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 C15orf56Q8N910 161 aa16.2■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 GNB1LQ9BYB4 327 aa16.2■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 SPANXA1Q9NS26 97 aa16.2■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 NDUFA5Q16718 116 aa16.19■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA1644Q3SXP7 199 aa16.19■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 AP5S1Q9NUS5 200 aa16.19■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 CNBPP62633 177 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 PCLOQ9Y6V0 5065 aa16.18■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.17■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 COX19Q49B96 90 aa16.17■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 HIGD2BQ4VC39 106 aa16.17■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 CD164L2Q6UWJ8 174 aa16.17■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 SVBPQ8N300 66 aa16.17■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 C9orf163Q8N9P6 203 aa16.17■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa16.16■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 FAM104AQ969W3 186 aa16.16■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 SNAPINO95295 136 aa16.15■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CXCL2-201ENST00000296031 ABCA13Q86UQ4 5058 aa16.14■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 SLPIP03973 132 aa16.14■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 EPM2AB3EWF7 344 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 K7EMI3 77 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 MT-ND6P03923 174 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 ORMDL2Q53FV1 153 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 FAT1Q14517 4588 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 Q5VSD8 79 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 SCXQ7RTU7 201 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 CHAC1Q9BUX1 264 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 CYSLTR1Q9Y271 337 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 C2orf66Q6UXQ4 117 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 SDIM1Q6ZPB5 146 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL2-201ENST00000296031 IFITM10A6NMD0 228 aa16.08■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 COX7A2LO14548 114 aa16.08■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 FABP9Q0Z7S8 132 aa16.08■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa16.07■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa16.07■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 MALP21145 153 aa16.07■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa16.06■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 FAM229AH3BQW9 127 aa16.05■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 G0S2P27469 103 aa16.05■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 C5orf38Q86SI9 138 aa16.05■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa16.05■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00526Q96FQ7 95 aa16.05■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM141Q96I45 108 aa16.05■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa16.02■□□□□ 0.16
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