RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 PRR9Q5T870 116 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB4AO15263 64 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 AMELXQ99217 191 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 ESM1Q9NQ30 184 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1B0GUV1 79 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 SERP2Q8N6R1 65 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 A0A087WZ39 114 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 CCKP06307 115 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 COL4A2P08572 1712 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 CACNA1DQ01668 2161 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 PRYO14603 147 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 C6orf99Q4VX62 202 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 USP17L23D6RBM5 183 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 ADAMTS20P59510 1910 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1B0GW54 56 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 KLK9Q2XQG4 91 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 K7ERS5 55 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV4-1P06312 121 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 CASC2Q6XLA1 102 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-201ENST00000261266 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 C5orf47Q569G3 176 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 ENHOQ6UWT2 76 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 C10orf25Q5T742 122 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 CACNA1BQ00975 2339 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 COX7CP15954 63 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 MT-ATP8P03928 68 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 FHL2Q14192 279 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 H3BNG1 76 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 PROK1P58294 105 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRB-201ENST00000261266 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 BCE1O60756 84 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 Q8N814 137 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 REG3GQ6UW15 175 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZQY7 126 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 GTF3C1Q12789 2109 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 DOCK7Q96N67 2140 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 FHL3Q13643 280 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0J9YWU9 116 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 C20orf197Q8N268 126 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00310P59036 64 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 SLPIP03973 132 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-201ENST00000261266 NCOR1O75376 2440 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 AVPP01185 164 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 MED12Q93074 2177 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZS46 218 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 CACNA1HO95180 2353 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 ABCA4P78363 2273 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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