RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 ENTPD3O75355 529 aa15□□□□□ -0.01
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CTIF-208ENST00000590422 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.92□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 TBC1D12O60347 775 aa14.91□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 HOXD10P28358 340 aa14.91□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 POLA2Q14181 598 aa14.91□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.91□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 SNRKQ9NRH2 765 aa14.91□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.91□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.91□□□□□ -0.02
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