RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	RLBP1	P12271	317 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF22	Q14807	665 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PPP4C-208	ENST00000564966	SSH3	Q8TE77	659 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PPP4C-208	ENST00000564966	SNRK	Q9NRH2	765 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PPP4C-208	ENST00000564966	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PPP4C-208	ENST00000564966	MCAM	P43121	646 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PPP4C-208	ENST00000564966	TNNI3K	Q59H18	835 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PPP4C-208	ENST00000564966	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PPP4C-208	ENST00000564966	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PPP4C-208	ENST00000564966	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PPP4C-208	ENST00000564966	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	TLR2	O60603	784 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	GPR108	Q9NPR9	543 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	PDHX	O00330	501 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF384	Q8TF68	577 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	RHBDL3	P58872	404 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	CAP1	Q01518	475 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	TEX11	Q8IYF3	940 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	PANK1	Q8TE04	598 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	SLURP2	P0DP57	97 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	CPA4	Q9UI42	421 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PPP4C-208	ENST00000564966	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		31.07	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	31.07	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	CXCL11	O14625	94 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPRA	P18433	802 aa		31.05	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM196B	A6NMK8	535 aa		31.04	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	BAG3	O95817	575 aa		31.04	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	NBPF11	Q86T75	865 aa		31.04	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	31.04	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	31.04	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	MS4A1	P11836	297 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	CEP85	Q6P2H3	762 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIM75P	A6NK02	468 aa		31.02	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	31.02	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	ARMC5	Q96C12	935 aa		31.02	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		31.02	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
PPP4C-208	ENST00000564966	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	POTEF	A5A3E0	1075 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	ZAP70	P43403	619 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP3K10	Q02779	954 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	C17orf99	Q6UX52	265 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	31	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP2C8	P10632	490 aa		31	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	PLCG2	P16885	1265 aa		31	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	MOGS	Q13724	837 aa		31	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	31	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	BCL11A	Q9H165	835 aa		31	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		31	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	DOCK1	Q14185	1865 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	30.99	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	PSMC4	P43686	418 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	30.99	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	30.99	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	TBC1D12	O60347	775 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	GNRH1	P01148	92 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	30.97	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	AACS	Q86V21	672 aa		30.97	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		30.97	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		30.97	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	30.97	■■■□□ 2.55
PPP4C-208	ENST00000564966	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	30.97	■■■□□ 2.55

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