RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 GORABQ5T7V8 394 aa24.74■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 PI16Q6UXB8 463 aa24.74■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 SSH3Q8TE77 659 aa24.74■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 DOCK2Q92608 1830 aa24.73■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 C17orf99Q6UX52 265 aa24.73■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 GPR108Q9NPR9 543 aa24.73■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 POTEFA5A3E0 1075 aa24.72■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 CXCL11O14625 94 aa24.72■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.72■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 PDHXO00330 501 aa24.71■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 LDHCP07864 332 aa24.71■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.71■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 MCAMP43121 646 aa24.71■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.71■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
MFGE8-208ENST00000558773 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.7■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 GSTO1P78417 241 aa24.7■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.7■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.7■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 TBC1D12O60347 775 aa24.69■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 SLURP2P0DP57 97 aa24.69■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 PTPRAP18433 802 aa24.69■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 PICALMQ13492 652 aa24.69■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 KIF22Q14807 665 aa24.69■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 TNNI3KQ59H18 835 aa24.69■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.69■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF333Q96JL9 665 aa24.69■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.69■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 SLC34A2O95436 690 aa24.68■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 GNRH1P01148 92 aa24.68■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 RLBP1P12271 317 aa24.68■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.68■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.68■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.68■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 PICK1Q9NRD5 415 aa24.67■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 RAI14Q9P0K7 980 aa24.67■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 CPA4Q9UI42 421 aa24.67■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 CTGFP29279 349 aa24.66■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 PRMT2P55345 433 aa24.66■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 NBPF11Q86T75 865 aa24.66■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.66■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.66■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.65■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.65■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.64■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.64■■□□□ 1.54
MFGE8-208ENST00000558773 DOCK1Q14185 1865 aa24.64■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 BRCA2P51587 3418 aa24.64■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.63■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.63■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.63■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 SNRKQ9NRH2 765 aa24.63■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 IGSF3O75054 1194 aa24.62■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 BCRP11274 1271 aa24.62■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 PSMC4P43686 418 aa24.62■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 TRIM47Q96LD4 638 aa24.62■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.62■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.62■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 CYP2C8P10632 490 aa24.61■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 PPP4CP60510 307 aa24.61■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 SRRDQ9UH36 339 aa24.61■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 TEX11Q8IYF3 940 aa24.6■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 PTPRFP10586 1907 aa24.6■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 FAM196BA6NMK8 535 aa24.59■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 OSBPP22059 807 aa24.59■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 HOXD10P28358 340 aa24.59■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 CEP85Q6P2H3 762 aa24.59■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.59■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
MFGE8-208ENST00000558773 BAG3O95817 575 aa24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 182.2 ms