RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.26■■□□□ 1.15
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COPS7A-216ENST00000543170 NOGQ13253 232 aa22.22■■□□□ 1.15
COPS7A-216ENST00000543170 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.22■■□□□ 1.15
COPS7A-216ENST00000543170 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
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COPS7A-216ENST00000543170 NEFLP07196 543 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7A-216ENST00000543170 MAP2K2P36507 400 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7A-216ENST00000543170 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7A-216ENST00000543170 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7A-216ENST00000543170 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
COPS7A-216ENST00000543170 SIPA1L1O43166 1804 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7A-216ENST00000543170 MYH1P12882 1939 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7A-216ENST00000543170 MAP3K10Q02779 954 aa22.2■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 TICAM2Q86XR7 235 aa22.2■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.19■■□□□ 1.14
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COPS7A-216ENST00000543170 TBC1D12O60347 775 aa22.18■■□□□ 1.14
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COPS7A-216ENST00000543170 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.17■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 LCORLQ8N3X6 602 aa22.17■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 CSADQ9Y600 493 aa22.17■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 PCNTO95613 3336 aa22.17■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 DOCK1Q14185 1865 aa22.16■■□□□ 1.14
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COPS7A-216ENST00000543170 CHGBP05060 677 aa22.16■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.16■■□□□ 1.14
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COPS7A-216ENST00000543170 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.16■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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COPS7A-216ENST00000543170 PDE4AP27815 886 aa22.15■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.15■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 ARMT1Q9H993 441 aa22.15■■□□□ 1.14
COPS7A-216ENST00000543170 HLA-DOAP06340 250 aa22.14■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 SPRYD7Q5W111 196 aa22.14■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 OSBP2Q969R2 916 aa22.14■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 WNK4Q96J92 1243 aa22.14■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.14■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.14■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.13■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.13■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 EHD4Q9H223 541 aa22.13■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 PALD1Q9ULE6 856 aa22.13■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.12■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 INPP5BP32019 993 aa22.12■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.12■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.12■■□□□ 1.13
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