RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	GNAI2	P04899	355 aa		19.84	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	BTD	P43251	543 aa		19.84	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	PRMT2	P55345	433 aa		19.84	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		19.84	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		19.84	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		19.84	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	PICK1	Q9NRD5	415 aa		19.84	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	PSMC4	P43686	418 aa		19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	MAP3K10	Q02779	954 aa		19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	MECOM	Q03112	1051 aa		19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	PICALM	Q13492	652 aa		19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	GORAB	Q5T7V8	394 aa		19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		19.83	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		19.83	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		19.82	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		19.82	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	PTPRA	P18433	802 aa		19.82	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	CTGF	P29279	349 aa		19.82	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	19.82	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		19.82	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	CENPF	P49454	3210 aa		19.82	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	19.81	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	SLURP2	P0DP57	97 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	HOXD10	P28358	340 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	SPATA5	Q8NB90	893 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	GCC1	Q96CN9	775 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	TRIM47	Q96LD4	638 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	SRRD	Q9UH36	339 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	LDHC	P07864	332 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	RHBDL3	P58872	404 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	GSTO1	P78417	241 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	PI16	Q6UXB8	463 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF384	Q8TF68	577 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	CYP2C8	P10632	490 aa		19.79	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	OSBP	P22059	807 aa		19.79	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		19.79	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	19.79	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	RAI14	Q9P0K7	980 aa		19.79	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	19.78	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	BCR	P11274	1271 aa		19.78	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	RAET1E	Q8TD07	263 aa		19.78	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		19.78	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	MYPN	Q86TC9	1320 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	DOCK1	Q14185	1865 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	TBC1D12	O60347	775 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	19.77	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	MCAM	P43121	646 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	19.77	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	19.77	■□□□□ 0.76
DDX11-222	ENST00000542777	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	GRK4	P32298	578 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	FCGRT	P55899	365 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	MTFR1	Q15390	333 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	PTPRF	P10586	1907 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	MGAM	O43451	1857 aa		19.75	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	TRIM75P	A6NK02	468 aa		19.75	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		19.75	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	19.75	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	FAM196B	A6NMK8	535 aa		19.74	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	POLA2	Q14181	598 aa		19.74	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	19.74	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	GPR108	Q9NPR9	543 aa		19.74	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	BRCA2	P51587	3418 aa		19.73	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	ATP8B2	P98198	1209 aa		19.73	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	PRKCZ	Q05513	592 aa		19.73	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	TNNI3K	Q59H18	835 aa		19.73	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	19.73	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		19.73	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	TEX11	Q8IYF3	940 aa		19.73	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	SNRK	Q9NRH2	765 aa		19.73	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		19.73	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		19.72	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	SSH3	Q8TE77	659 aa		19.72	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		19.72	■□□□□ 0.75
DDX11-222	ENST00000542777	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	19.72	■□□□□ 0.75

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