RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.89■■■□□ 2.06
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TRDMT1-211ENST00000495022 GNAI2P04899 355 aa27.88■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP3K10Q02779 954 aa27.88■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 BTDP43251 543 aa27.87■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.87■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 SCYL3Q8IZE3 742 aa27.87■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 CPA4Q9UI42 421 aa27.87■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa27.86■■■□□ 2.05
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TRDMT1-211ENST00000495022 ATAD5Q96QE3 1844 aa27.86■■■□□ 2.05
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TRDMT1-211ENST00000495022 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.86■■■□□ 2.05
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TRDMT1-211ENST00000495022 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
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TRDMT1-211ENST00000495022 NPM3O75607 178 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 BCAR3O75815 825 aa27.84■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPRAP18433 802 aa27.84■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 PSMC4P43686 418 aa27.84■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa27.84■■■□□ 2.05
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TRDMT1-211ENST00000495022 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDH10Q9P2E7 1040 aa27.84■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 ZHX2Q9Y6X8 837 aa27.84■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 HOXD10P28358 340 aa27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 RHBDL3P58872 404 aa27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 PICALMQ13492 652 aa27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 GORABQ5T7V8 394 aa27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA5Q8NB90 893 aa27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 SH3TC2Q8TF17 1288 aa27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF384Q8TF68 577 aa27.83■■■□□ 2.05
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TRDMT1-211ENST00000495022 SRRDQ9UH36 339 aa27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 TNNQ9UQP3 1299 aa27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1-211ENST00000495022 MAST2Q6P0Q8 1798 aa27.82■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.82■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 CTGFP29279 349 aa27.82■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 GSTO1P78417 241 aa27.82■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa27.82■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 DOCK3Q8IZD9 2030 aa27.81■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa27.81■■■□□ 2.04
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TRDMT1-211ENST00000495022 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.81■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
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TRDMT1-211ENST00000495022 BCRP11274 1271 aa27.8■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 PI16Q6UXB8 463 aa27.8■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa27.8■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 FOCADQ5VW36 1801 aa27.79■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 OSBPP22059 807 aa27.79■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.78■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP2C8P10632 490 aa27.78■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.78■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 MCAMP43121 646 aa27.77■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.77■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.77■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 RAET1EQ8TD07 263 aa27.77■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 RAI14Q9P0K7 980 aa27.77■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 MYPNQ86TC9 1320 aa27.77■■■□□ 2.04
TRDMT1-211ENST00000495022 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
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TRDMT1-211ENST00000495022 GADL1Q6ZQY3 521 aa27.76■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.76■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR108Q9NPR9 543 aa27.76■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 SLURP2P0DP57 97 aa27.75■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 GRK4P32298 578 aa27.75■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 FCGRTP55899 365 aa27.75■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 POLA2Q14181 598 aa27.75■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 SIPA1L1O43166 1804 aa27.74■■■□□ 2.03
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TRDMT1-211ENST00000495022 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27.73■■■□□ 2.03
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TRDMT1-211ENST00000495022 SSH3Q8TE77 659 aa27.73■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 MTFR1Q15390 333 aa27.72■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 TNNI3KQ59H18 835 aa27.72■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.72■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa27.72■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.72■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP8B2P98198 1209 aa27.71■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 PRKCZQ05513 592 aa27.71■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 TEX11Q8IYF3 940 aa27.71■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
TRDMT1-211ENST00000495022 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
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