RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 SLURP2P0DP57 97 aa28.11■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 PTPN22Q9Y2R2 807 aa28.11■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 TNNI3KQ59H18 835 aa28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 RAI14Q9P0K7 980 aa28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 HTTP42858 3142 aa28.09■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.09■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 RHBDL3P58872 404 aa28.09■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 DBNDD2Q9BQY9 259 aa28.09■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 PHF20L1A8MW92 1017 aa28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 GPR108Q9NPR9 543 aa28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 SNRKQ9NRH2 765 aa28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 KCNH4Q9UQ05 1017 aa28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-216ENST00000478603 TLR2O60603 784 aa28.07■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 TTC39AQ5SRH9 613 aa28.07■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 LDHCP07864 332 aa28.06■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 GSTO1P78417 241 aa28.06■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 PANK1Q8TE04 598 aa28.06■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 LRP2BPQ9P2M1 347 aa28.06■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 SCYL3Q8IZE3 742 aa28.05■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 DOCK1Q14185 1865 aa28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 MAP3K10Q02779 954 aa28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 MOGSQ13724 837 aa28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 CCDC158Q5M9N0 1113 aa28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 ANKRD23Q86SG2 305 aa28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 PDHXO00330 501 aa28.03■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 MAST2Q6P0Q8 1798 aa28.03■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 PHIPQ8WWQ0 1821 aa28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 CEP85Q6P2H3 762 aa28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 PICK1Q9NRD5 415 aa28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 CPA4Q9UI42 421 aa28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 ZHX2Q9Y6X8 837 aa28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 PTPRFP10586 1907 aa28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 CENPFP49454 3210 aa28.01■■■□□ 2.08
C9orf3-216ENST00000478603 FAM196BA6NMK8 535 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 PTPRAP18433 802 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 CXCL11O14625 94 aa28■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 NPM3O75607 178 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 ARHGEF6Q15052 776 aa28■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 TEX11Q8IYF3 940 aa28■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 POTEFA5A3E0 1075 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 C17orf99Q6UX52 265 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 ARMC5Q96C12 935 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 ADGRA2Q96PE1 1338 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 ZAP70P43403 619 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 KIF22Q14807 665 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 GPAT2Q6NUI2 795 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 ATAD5Q96QE3 1844 aa27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 ADGRA1Q86SQ6 560 aa27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP27.97■■■□□ 2.072e-7■■■□□ 18.7
C9orf3-216ENST00000478603 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 TBC1D12O60347 775 aa27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 CTGFP29279 349 aa27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
C9orf3-216ENST00000478603 CYP2C8P10632 490 aa27.95■■■□□ 2.06
C9orf3-216ENST00000478603 GADL1Q6ZQY3 521 aa27.95■■■□□ 2.06
C9orf3-216ENST00000478603 SIPA1L1O43166 1804 aa27.95■■■□□ 2.06
C9orf3-216ENST00000478603 FOCADQ5VW36 1801 aa27.95■■■□□ 2.06
C9orf3-216ENST00000478603 TRIM75PA6NK02 468 aa27.94■■■□□ 2.06
C9orf3-216ENST00000478603 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa27.94■■■□□ 2.06
C9orf3-216ENST00000478603 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
C9orf3-216ENST00000478603 BAG3O95817 575 aa27.93■■■□□ 2.06
C9orf3-216ENST00000478603 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
C9orf3-216ENST00000478603 ZNF333Q96JL9 665 aa27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms