RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	GOLIM4	O00461	696 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHGB	P05060	677 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	LBX1	P52954	281 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	GSTO1	P78417	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	INPP5B	P32019	993 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYH8	P13535	1937 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	ENTPD3	O75355	529 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	LDHC	P07864	332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP7A1	P22680	504 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	FLT1	P17948	1338 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE6A	P16499	860 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP5J	P18859	108 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRPA1	O75762	1119 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	HAUS7	Q99871	368 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP4C	P60510	307 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	EVX2	Q03828	476 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHD	P01880	384 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	TM4SF4	P48230	202 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	BAG3	O95817	575 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADD2	P35612	726 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTPN18	Q99952	460 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	IRF6	O14896	467 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	CA12	O43570	354 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBC1D8	O95759	1140 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLCG2	P16885	1265 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SREBF2	Q12772	1141 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGSF3	O75054	1194 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	MX1	P20591	662 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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