RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.59□□□□□ -1.03
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RABGEF1-206ENST00000461017 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-206ENST00000461017 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.59□□□□□ -1.03
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RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC102AQ96A19 550 aa8.59□□□□□ -1.03
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RABGEF1-206ENST00000461017 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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RABGEF1-206ENST00000461017 ELP3Q9H9T3 547 aa8.58□□□□□ -1.04
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RABGEF1-206ENST00000461017 FAM196BA6NMK8 535 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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RABGEF1-206ENST00000461017 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF186Q9NXI6 227 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.57□□□□□ -1.04
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RABGEF1-206ENST00000461017 DOCK1Q14185 1865 aa8.57□□□□□ -1.04
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RABGEF1-206ENST00000461017 DOCK3Q8IZD9 2030 aa8.56□□□□□ -1.04
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRPA1O75762 1119 aa8.56□□□□□ -1.04
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RABGEF1-206ENST00000461017 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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RABGEF1-206ENST00000461017 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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RABGEF1-206ENST00000461017 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 AIDAQ96BJ3 306 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 WRNIP1Q96S55 665 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 HAUS7Q99871 368 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-206ENST00000461017 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.55□□□□□ -1.04
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